78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1974 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1000    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  77.58 
 
 		 472 aa  723    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  58.19 
 
 		 482 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  56.55 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  53.12 
 
 		 738 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  52.05 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  47.64 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  45.29 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  44.8 
 
 		 765 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  43.21 
 
 		 760 aa  342  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  43.94 
 
 		 759 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  41.07 
 
 		 755 aa  317  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  52.28 
 
 		 479 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  36.57 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  36.57 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  34.33 
 
 		 798 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  33.63 
 
 		 524 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  33.56 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  34.26 
 
 		 782 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  33.02 
 
 		 717 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  35.14 
 
 		 695 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  33.41 
 
 		 717 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  32.79 
 
 		 717 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  33.65 
 
 		 874 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  33.65 
 
 		 874 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  30.38 
 
 		 843 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  30.06 
 
 		 842 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  33.08 
 
 		 725 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  28.6 
 
 		 900 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.55 
 
 		 746 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.55 
 
 		 746 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  29.85 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.25 
 
 		 857 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  28.27 
 
 		 723 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  25.63 
 
 		 770 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  26.79 
 
 		 697 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  32.03 
 
 		 882 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  27.1 
 
 		 774 aa  147  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  35.29 
 
 		 612 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.57 
 
 		 757 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  34.32 
 
 		 613 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  29.79 
 
 		 624 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  30.75 
 
 		 955 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  25.92 
 
 		 788 aa  131  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  31.3 
 
 		 799 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.16 
 
 		 632 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  28.16 
 
 		 540 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  27.48 
 
 		 828 aa  93.6  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  23.78 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  21.84 
 
 		 769 aa  84  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  23.56 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.85 
 
 		 1145 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  21.56 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  25 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  21.55 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  24.93 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  21.12 
 
 		 1000 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  22.9 
 
 		 606 aa  58.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  24.8 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1079  DNA primase small subunit  27.72 
 
 		 1036 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  23.43 
 
 		 1172 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0479  ATPase-like protein  27.72 
 
 		 1039 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  23.43 
 
 		 1172 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0564  ATPase-like  23.79 
 
 		 902 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0661178  normal  0.572377 
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  28.67 
 
 		 1061 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  25.1 
 
 		 777 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  25.93 
 
 		 777 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  22.93 
 
 		 1285 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  25.51 
 
 		 776 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  24.28 
 
 		 777 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  24.28 
 
 		 777 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  29.75 
 
 		 978 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  25.76 
 
 		 777 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  24.69 
 
 		 777 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  25.16 
 
 		 775 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  22.71 
 
 		 775 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  19.49 
 
 		 501 aa  47  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0022  ATPase-like protein  23.96 
 
 		 548 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>