173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0788 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  94.34 
 
 		 479 aa  919    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  67.03 
 
 		 483 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 		 479 aa  989    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  68.09 
 
 		 485 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  66.67 
 
 		 491 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  99.37 
 
 		 479 aa  985    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  83.09 
 
 		 481 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 791 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  64.49 
 
 		 791 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  63.81 
 
 		 791 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  61.96 
 
 		 777 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 844 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  65.77 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  62.29 
 
 		 810 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  40.39 
 
 		 775 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  44.07 
 
 		 389 aa  280  5e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  40.49 
 
 		 343 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  40 
 
 		 345 aa  276  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  39.9 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  40.74 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  41.03 
 
 		 358 aa  265  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  32.05 
 
 		 313 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  31.22 
 
 		 324 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.8 
 
 		 347 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  31.31 
 
 		 318 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  30.41 
 
 		 373 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  29.83 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  30.68 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  33.93 
 
 		 418 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  30.58 
 
 		 320 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  30.83 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  30.07 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  28.67 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.34 
 
 		 321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  30.34 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  28.85 
 
 		 321 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  28.61 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  30.34 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  29.49 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  28.02 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  39.41 
 
 		 328 aa  123  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  27.85 
 
 		 363 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  27.25 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  28.18 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  28.43 
 
 		 315 aa  113  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.29 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  36.57 
 
 		 312 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.68 
 
 		 314 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  33.8 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  34.72 
 
 		 312 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  35.02 
 
 		 313 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  26.18 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  25.74 
 
 		 479 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  36.18 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  29.23 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  29.23 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  34.65 
 
 		 314 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  35.53 
 
 		 319 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  33.17 
 
 		 381 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  34.34 
 
 		 314 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  27.02 
 
 		 305 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  27.04 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  26.4 
 
 		 329 aa  93.2  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  27.86 
 
 		 318 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  26.35 
 
 		 329 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.38 
 
 		 340 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  27.95 
 
 		 329 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.67 
 
 		 330 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  28.35 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 303 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  26.4 
 
 		 329 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  27.27 
 
 		 328 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  26.35 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  28.71 
 
 		 291 aa  90.9  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.26 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  24.82 
 
 		 303 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.88 
 
 		 285 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  32.51 
 
 		 298 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.23 
 
 		 498 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  24.64 
 
 		 303 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0805  acetamidase/formamidase  26.56 
 
 		 285 aa  87.8  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  25.62 
 
 		 350 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  27.38 
 
 		 336 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  26.23 
 
 		 337 aa  87.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  25.63 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  26.73 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.51 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  28.43 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  28.16 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  27.69 
 
 		 311 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1866  Acetamidase/Formamidase  26.15 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0100916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  33.01 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  31.88 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  25.71 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  25.57 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  25.57 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>