More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2331 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  49.84 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  32.94 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  36.93 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 359 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  30.29 
 
 		 364 aa  132  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 544 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 362 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.24 
 
 		 362 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  31.49 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 385 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  30.74 
 
 		 538 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 		 393 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  31.5 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  31.05 
 
 		 531 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 547 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.58 
 
 		 275 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  33.51 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  34.69 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 550 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 540 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0014  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 591 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 		 275 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 341 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  29.9 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  32.83 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  29.38 
 
 		 286 aa  108  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  28.67 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  33 
 
 		 533 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  26.48 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  31.32 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  29.06 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.57 
 
 		 806 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  31.8 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  28.9 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  35.96 
 
 		 534 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  26.1 
 
 		 359 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  25.08 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 200 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  27.44 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  29.63 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  26.42 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1775  MscS mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 429 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  26.95 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  26.91 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>