222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1755 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  100 
 
 
247 aa  510  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  46.77 
 
 
235 aa  222  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  39.43 
 
 
236 aa  175  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  38.43 
 
 
228 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  36.36 
 
 
228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  35.92 
 
 
231 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  30.92 
 
 
266 aa  129  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  30.08 
 
 
512 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  31.74 
 
 
488 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  31.3 
 
 
500 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  29.27 
 
 
509 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  30.87 
 
 
498 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  30.87 
 
 
509 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  31.3 
 
 
500 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  32.17 
 
 
509 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  30 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 
519 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  31.3 
 
 
514 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  30.71 
 
 
519 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  31.17 
 
 
510 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.57 
 
 
512 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0348  circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 
528 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  30.6 
 
 
510 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1016  circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 
519 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.026109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5077  putative circadian clock protein KaiC  29.67 
 
 
514 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.952613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  29.67 
 
 
478 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6554  circadian clock protein KaiC  30.53 
 
 
584 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  29.87 
 
 
509 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  28.57 
 
 
259 aa  105  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  28.23 
 
 
506 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 
507 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  27.39 
 
 
507 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4231  circadian clock protein KaiC  28.86 
 
 
521 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4293  circadian clock protein KaiC  28.86 
 
 
521 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143998 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  30.77 
 
 
402 aa  102  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  31.28 
 
 
505 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  29.27 
 
 
344 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  28.4 
 
 
224 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0599  circadian clock protein KaiC  29.05 
 
 
520 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1663  circadian clock protein KaiC  28.28 
 
 
574 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455072  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  28.74 
 
 
362 aa  99.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  30.4 
 
 
497 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
504 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1361  circadian clock protein KaiC  28.38 
 
 
565 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.438271  hitchhiker  0.000777387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  28.74 
 
 
494 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1484  circadian clock protein KaiC  28.28 
 
 
573 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0275855  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  31.1 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  31.1 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  28.23 
 
 
494 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  26.15 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  30.56 
 
 
508 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  27.71 
 
 
504 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  29.08 
 
 
499 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
364 aa  92  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
503 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  30.13 
 
 
505 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0671  putative circadian clock protein, KaiC  29.91 
 
 
535 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  30.4 
 
 
506 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  26.42 
 
 
482 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  29.39 
 
 
505 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 
507 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
503 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  27.43 
 
 
570 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  23.98 
 
 
459 aa  87.4  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2003  putative circadian clock protein, KaiC  29.07 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  30.9 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  30.04 
 
 
280 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 
500 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  28.86 
 
 
489 aa  86.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0009  circadian clock protein KaiC  26.02 
 
 
563 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.310441  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  30.21 
 
 
281 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3120  putative circadian clock protein, KaiC  26.56 
 
 
575 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374294  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  30.3 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2366  putative circadian clock protein, KaiC  29.23 
 
 
258 aa  87  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160155  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4110  circadian clock protein KaiC  27.63 
 
 
575 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4478  circadian clock protein KaiC  27.63 
 
 
575 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79331  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3311  circadian clock protein KaiC  28.76 
 
 
570 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
520 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  29.52 
 
 
520 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  25.11 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  30.7 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2967  circadian clock protein KaiC  27.63 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  28.34 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  31.3 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4591  circadian clock protein KaiC  27.19 
 
 
567 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277881  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0651  putative circadian clock protein, KaiC  29.5 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.938042  hitchhiker  0.00276287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  31.03 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  26.72 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1291  putative circadian clock protein, KaiC  29.39 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0235304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  26.83 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0741  circadian clock protein KaiC  26.43 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  24.39 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0628  putative circadian clock protein, KaiC  28.93 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.60194  normal  0.0153191 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 
480 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  26.74 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  26.48 
 
 
472 aa  82  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>