More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1864 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
272 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  43.31 
 
 
288 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  39.76 
 
 
273 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.7 
 
 
276 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  37.5 
 
 
278 aa  142  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.27 
 
 
270 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.61 
 
 
271 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.17 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.08 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.41 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.69 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.68 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  33.08 
 
 
275 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.73 
 
 
271 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.52 
 
 
271 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.27 
 
 
271 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 
269 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.9 
 
 
265 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.55 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  35.68 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  33.98 
 
 
269 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  38.68 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  34.26 
 
 
269 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 
269 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  37.04 
 
 
269 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.31 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.9 
 
 
271 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  36.36 
 
 
269 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.55 
 
 
269 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.55 
 
 
282 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.73 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  30.98 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.38 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.39 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.54 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  33.06 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.82 
 
 
269 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 
305 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  33.47 
 
 
277 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  32.24 
 
 
294 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  32.96 
 
 
288 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.65 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.65 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.05 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.65 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.05 
 
 
265 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
288 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.21 
 
 
268 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  32.66 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  31.11 
 
 
298 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  33.33 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.45 
 
 
269 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 
269 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  31.54 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.88 
 
 
267 aa  94.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.11 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  32.11 
 
 
269 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 
277 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  33.98 
 
 
277 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 
269 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  35.23 
 
 
268 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0121  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase-like protein  30.95 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.74 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  31.02 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  31.66 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  34.9 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.05 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  32.77 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.48 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.38 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  29.84 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.85 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.35 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  31.95 
 
 
293 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 
300 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  28.16 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  28.86 
 
 
284 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  30.58 
 
 
299 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  31.58 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.4 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  31.89 
 
 
288 aa  85.5  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  29.07 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.84 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.89 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1632  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.95 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.114958  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.89 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>