139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0508 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0508  strictosidine synthase  100 
 
 		 363 aa  732    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  60.96 
 
 		 353 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  61.56 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1772  gluconolactonase  61.45 
 
 		 354 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.338727  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3429  strictosidine synthase  43.54 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01780  hypothetical protein  39.44 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.748339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3130  strictosidine synthase  42.3 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2400  strictosidine synthase  42.69 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3292  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 706 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0638637  normal  0.743935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4828  ABC transporter  38.4 
 
 		 707 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2429  gluconolactonase  35.1 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2860  strictosidine synthase  37.59 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3535  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 704 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805371  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4855  strictosidine synthase  36.51 
 
 		 599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1568  strictosidine synthase  37.88 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4863  strictosidine synthase  36.8 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0592585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6052  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.15 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1671  hypothetical protein  35.11 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0387951  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  32.55 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  32.04 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  32.04 
 
 		 337 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44479  predicted protein  29.83 
 
 		 453 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00279246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3534  strictosidine synthase  25.98 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.79 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4827  hypothetical protein  24.78 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639685  normal  0.827203 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.76 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3293  strictosidine synthase  23.77 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894775  normal  0.62202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.23 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.27 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.44 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.27 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.44 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  29.47 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  27.2 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4785  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.25 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.97 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.08 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  30.05 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.97 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.65 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.59 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2237  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  25.11 
 
 		 281 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  25.55 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  24.26 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  32.58 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  24.91 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  26.49 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.59 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.59 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  23.11 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  26.42 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.6 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.23 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  25.98 
 
 		 281 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  28.57 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.23 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4109  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.97 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.09 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  27.32 
 
 		 287 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  22.74 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  26.11 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  28.02 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  22.36 
 
 		 286 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  25.26 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  25.45 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  23.43 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  30.23 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  25.41 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  23.58 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  29.65 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  25.49 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2553  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  22.33 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.66 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  27.47 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.84 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  26.79 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  26.16 
 
 		 352 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.92 
 
 		 268 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  25.65 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  24.86 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  25.13 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  26.2 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  25.43 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  24.86 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  24.86 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  25.13 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3944  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.64 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  28.81 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  27.87 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  25 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  26.59 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  24.7 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  26.92 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  23.98 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  25.27 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  24.38 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2119  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.97 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>