More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1324 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  100 
 
 
342 aa  686    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  61.64 
 
 
304 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  58.36 
 
 
304 aa  348  5e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  59.02 
 
 
304 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  59.47 
 
 
304 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  46.85 
 
 
526 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 
322 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  42 
 
 
306 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  43.13 
 
 
311 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 
308 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 
305 aa  185  9e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  39.08 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 
310 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 
313 aa  179  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  40.8 
 
 
320 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 
312 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  41.09 
 
 
322 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  36.65 
 
 
314 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 
308 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 
308 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 
320 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  38.96 
 
 
316 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.84 
 
 
313 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 
309 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 
320 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  36.17 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  43.78 
 
 
285 aa  175  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.72 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  40.31 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  42.52 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  39.73 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  40.46 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  34.15 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 
308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  37.6 
 
 
310 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.79 
 
 
309 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.85 
 
 
309 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  36.64 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0679  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 
317 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.451406  normal  0.332479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 
313 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 
320 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 
311 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
309 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 
316 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 
309 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  38.72 
 
 
311 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  34.32 
 
 
334 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.33 
 
 
542 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 
317 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  38.1 
 
 
320 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  35.79 
 
 
309 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 
316 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 
309 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 
326 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  36.47 
 
 
316 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  41.5 
 
 
308 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 
293 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  40 
 
 
316 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  33.01 
 
 
324 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  41.34 
 
 
317 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  40.39 
 
 
313 aa  169  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 
316 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 
309 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 
310 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 
309 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  41.57 
 
 
313 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 
339 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  36.82 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 
318 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 
310 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 
321 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 
310 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  40.24 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  42 
 
 
308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  37.09 
 
 
309 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 
310 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 
310 aa  165  9e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  40.78 
 
 
310 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  38.81 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  40.71 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1022  porphobilinogen deaminase  37.31 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  38.1 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>