More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1101 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 149 aa  308  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  76.51 
 
 		 149 aa  249  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  73.15 
 
 		 149 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  73.15 
 
 		 149 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  73.15 
 
 		 149 aa  243  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  41.78 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  47.97 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  41.61 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  44.22 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  43.45 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  42.18 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  42.76 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  40.94 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  38.62 
 
 		 159 aa  120  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  48.97 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  44.97 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  38.41 
 
 		 194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  32.65 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  38.82 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  39.19 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  34.07 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  39.47 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  36.72 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  38.16 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  33.82 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  39.16 
 
 		 162 aa  99.4  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  33.8 
 
 		 176 aa  97.1  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  34.75 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  36.17 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.84 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  29.5 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  30.99 
 
 		 174 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  34.97 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  32.17 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  32.87 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  33.63 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  33.63 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  34.38 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  33.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  30.71 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  33.59 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  30.07 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  32.87 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  31.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  31.47 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  33.87 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  27.91 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0796  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000812257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  29.37 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  31.47 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  28.68 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  35.4 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  31.9 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4293  ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  30.07 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1115  30S ribosomal protein S13  32.03 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195338  normal  0.589555 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 123 aa  57  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0499  30S ribosomal protein S13  27.13 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000323492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4482  30S ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  32.81 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  28.12 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  31.25 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  29.69 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  32.76 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  30.47 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  28.91 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  30.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>