More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1672 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  50.34 
 
 		 773 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  100 
 
 		 759 aa  1546    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  53.11 
 
 		 775 aa  764    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  51.18 
 
 		 773 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  50.34 
 
 		 773 aa  745    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  47.9 
 
 		 780 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  51.04 
 
 		 773 aa  742    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  43.81 
 
 		 827 aa  640    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  50 
 
 		 774 aa  747    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  53.16 
 
 		 772 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  51.13 
 
 		 778 aa  726    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  50.69 
 
 		 780 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  44.71 
 
 		 830 aa  655    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  48.14 
 
 		 772 aa  697    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  45.87 
 
 		 777 aa  665    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  50.14 
 
 		 748 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  43.54 
 
 		 827 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  50.34 
 
 		 773 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  49.86 
 
 		 773 aa  743    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  52.54 
 
 		 774 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  45.24 
 
 		 881 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  47.54 
 
 		 732 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  46.88 
 
 		 776 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  40.21 
 
 		 781 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  41.18 
 
 		 779 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  39.58 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  40.78 
 
 		 774 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  40.16 
 
 		 768 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  41.26 
 
 		 791 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  40.08 
 
 		 742 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  40.65 
 
 		 774 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  41.17 
 
 		 768 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  40.37 
 
 		 764 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  40.51 
 
 		 774 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  40.57 
 
 		 764 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  40.16 
 
 		 764 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  39.54 
 
 		 790 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  41.89 
 
 		 790 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  42.97 
 
 		 777 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  41.19 
 
 		 796 aa  534  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  39.73 
 
 		 790 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 787 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 769 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  40 
 
 		 789 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  40.99 
 
 		 779 aa  525  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  42.54 
 
 		 826 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  39.53 
 
 		 791 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  40.36 
 
 		 826 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  41.32 
 
 		 833 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  39.75 
 
 		 814 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  40 
 
 		 827 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  40.85 
 
 		 840 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  40.85 
 
 		 840 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  40.85 
 
 		 840 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  40.85 
 
 		 840 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  39.03 
 
 		 813 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  40.48 
 
 		 836 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  40.71 
 
 		 840 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  40.99 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  41.13 
 
 		 844 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  41.13 
 
 		 844 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  41.13 
 
 		 844 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  40.99 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  40.99 
 
 		 840 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  41.13 
 
 		 844 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  38.18 
 
 		 826 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  40.99 
 
 		 844 aa  491  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  38.31 
 
 		 826 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  38.18 
 
 		 824 aa  490  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  40.99 
 
 		 844 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  38.78 
 
 		 730 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  37.55 
 
 		 766 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  38.35 
 
 		 792 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  38.48 
 
 		 792 aa  480  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  40.34 
 
 		 841 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  38.74 
 
 		 754 aa  473  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 757 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 766 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  30.41 
 
 		 890 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 643 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.15 
 
 		 761 aa  324  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 643 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 751 aa  321  3e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.22 
 
 		 648 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.5 
 
 		 681 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  33.96 
 
 		 642 aa  317  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.18 
 
 		 649 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.42 
 
 		 642 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.02 
 
 		 683 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.31 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 		 661 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 		 662 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  32.1 
 
 		 705 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.61 
 
 		 656 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  37.83 
 
 		 796 aa  301  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 683 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 		 742 aa  299  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.81 
 
 		 739 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>