More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3141 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  69.8 
 
 		 605 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.532995  normal  0.915588 
 
 
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NC_011757  Mchl_2989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.85 
 
 		 611 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.907848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0206  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  90.12 
 
 		 597 aa  944    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2762  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  73.02 
 
 		 611 aa  753    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  72.56 
 
 		 611 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1563  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.16 
 
 		 610 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.553946 
 
 
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NC_010511  M446_3141  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 597 aa  1134    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0346516 
 
 
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NC_011666  Msil_3073  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.91 
 
 		 603 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.12 
 
 		 626 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.37 
 
 		 613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2962  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.37 
 
 		 613 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2813  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.65 
 
 		 613 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0113123  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_2499  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.88 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.408241  normal  0.222109 
 
 
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NC_009485  BBta_4000  exonuclease RecJ  57.43 
 
 		 613 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_1645  RecJ exonuclease  56.3 
 
 		 613 aa  571  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.79109 
 
 
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NC_009667  Oant_1920  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.76 
 
 		 594 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004310  BR1270  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.52 
 
 		 594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2307  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.52 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1547  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.17 
 
 		 600 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1741  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.67 
 
 		 600 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
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NC_008254  Meso_0990  exonuclease RecJ  54.93 
 
 		 594 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1231  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.34 
 
 		 575 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.337799  n/a   
 
 
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NC_008783  BARBAKC583_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.83 
 
 		 594 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209081  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2280  single-stranded-DNA-specific exonuclease  54.3 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340529  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_1452  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.5 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00256801  hitchhiker  0.00132955 
 
 
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NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.69 
 
 		 603 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
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NC_008686  Pden_1877  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.45 
 
 		 580 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0832  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.6 
 
 		 583 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
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NC_007493  RSP_0405  single-stranded DNA-specific exonuclease  51.26 
 
 		 583 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1296  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.67 
 
 		 594 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2059  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.26 
 
 		 583 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_2166  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 603 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.145891 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1506  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.09 
 
 		 603 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2274  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349175  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2408  RecJ exonuclease  47.89 
 
 		 606 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3002  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.32 
 
 		 582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.728985  normal  0.47011 
 
 
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NC_009952  Dshi_2275  single-stranded-DNA-specific exonuclease  48.98 
 
 		 585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.59 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.84 
 
 		 589 aa  437  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4733  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.66 
 
 		 588 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  41.07 
 
 		 584 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3014  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.74 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.858016 
 
 
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NC_010338  Caul_3011  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.18 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245556  normal  1 
 
 
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NC_007798  NSE_0712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.39 
 
 		 577 aa  392  1e-108  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2502  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.36 
 
 		 619 aa  392  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.386511  normal  0.196855 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  41.18 
 
 		 592 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.27 
 
 		 574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.8 
 
 		 586 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.56 
 
 		 907 aa  320  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.77 
 
 		 814 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.13 
 
 		 599 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.13 
 
 		 568 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.06 
 
 		 811 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.32 
 
 		 573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.33 
 
 		 798 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.05 
 
 		 578 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.74 
 
 		 574 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.35 
 
 		 788 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.56 
 
 		 574 aa  299  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.57 
 
 		 576 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  35.77 
 
 		 932 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.49 
 
 		 569 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.45 
 
 		 580 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.54 
 
 		 885 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.87 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.51 
 
 		 827 aa  290  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.78 
 
 		 564 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.29 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.14 
 
 		 585 aa  286  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  38.23 
 
 		 578 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  36.74 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.19 
 
 		 573 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.28 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  38.77 
 
 		 577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  39.29 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  39.96 
 
 		 565 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  39.29 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.96 
 
 		 573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  39.29 
 
 		 577 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.26 
 
 		 563 aa  283  7.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  39.29 
 
 		 577 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.96 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.43 
 
 		 572 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.93 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 569 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  38.66 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.93 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  38 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  38.66 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  38.66 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  40.59 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  38.66 
 
 		 577 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.24 
 
 		 763 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.84 
 
 		 732 aa  280  5e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.75 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  280  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.04 
 
 		 573 aa  280  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.26 
 
 		 569 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  38.46 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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