More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4183 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  100 
 
 		 492 aa  988    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.19 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  45.11 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.77 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.83 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.63 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  41.56 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 482 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2661  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0327795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.66 
 
 		 517 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.35 
 
 		 479 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3431  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 492 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.875541  normal  0.885014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3558  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 497 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4039  transcriptional regulator  42.02 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.185178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.85 
 
 		 470 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.93 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 504 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4436  transcriptional regulator  41.04 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  41.65 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.99 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 477 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.28 
 
 		 473 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.96 
 
 		 487 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.89 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1880  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 471 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 473 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.6 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 474 aa  334  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 489 aa  333  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  38.88 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.13 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 479 aa  329  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  39.61 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  36.81 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.64 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 530 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 475 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.04 
 
 		 470 aa  326  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  36.91 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  36.81 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 474 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 473 aa  324  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.61 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 471 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  42.18 
 
 		 482 aa  323  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.38 
 
 		 475 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.66 
 
 		 471 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 481 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.13 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 473 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  35.16 
 
 		 471 aa  319  7e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 473 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 475 aa  319  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 473 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  35.99 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 477 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 532 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.89 
 
 		 474 aa  317  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 482 aa  316  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  38.85 
 
 		 483 aa  316  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  38.36 
 
 		 473 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 479 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  37.79 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>