More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3457 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1063  ABC transporter-related protein  67.25 
 
 		 512 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.83963  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2447  ABC transporter related  69.35 
 
 		 533 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1005  ABC transporter, ATPase subunit  68.21 
 
 		 512 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3166  ABC transporter related  68.27 
 
 		 508 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1483  ABC transporter related  69.82 
 
 		 514 aa  692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 519 aa  1041    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3903  ABC transporter related  70.18 
 
 		 511 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2376  ABC transporter related  64.36 
 
 		 504 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.390986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1066  ABC transporter related  68.01 
 
 		 512 aa  663    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1976  ABC transporter related  64.52 
 
 		 516 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2135  ABC transporter related  69.7 
 
 		 533 aa  693    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597134  normal  0.305125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1132  ABC transporter-related protein  70.38 
 
 		 504 aa  694    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1036  ABC transporter related  67.88 
 
 		 524 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0725845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3101  ABC transporter related  68.97 
 
 		 533 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3173  ABC transporter related  69.02 
 
 		 512 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.590502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5003  ABC transporter related  68.62 
 
 		 527 aa  647    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0803  putative sugar ATP binding ABC transporter protein  77.22 
 
 		 509 aa  760    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2173  sugar ATP binding ABC transporter protein  64.09 
 
 		 508 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.83271  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2498  ABC transporter related  64.22 
 
 		 524 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0797  ABC transporter-related protein  65.4 
 
 		 537 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1938  ABC transporter, fused ATPase subunits  61.21 
 
 		 533 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1291  ABC transporter related  61.24 
 
 		 539 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1357  ABC transporter related  61.55 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2321  ABC transporter related  60.61 
 
 		 533 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.640938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0838  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.624607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0673  ABC transporter  55.12 
 
 		 517 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.918882  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5874  ABC transporter related  54.53 
 
 		 511 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2990  ABC transporter related  55.4 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0926218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0769  ABC transporter, ATP-binding protein  55.82 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0681  ABC transporter-like  53.24 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000167048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01670  putative ATP-binding component of ABC transporter  55.91 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256924  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1926  ABC transporter related  51.09 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.748491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1905  ABC transporter component  55.8 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0213  ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0557881  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6464  ABC transporter related  54.27 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51387  normal  0.933482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  53.88 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3632  ABC transporter related  49.41 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0570  ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1716  ABC transporter related  49.5 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2961  ABC transporter ATP binding protein  50.6 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.143665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0496  ABC transporter related  50.7 
 
 		 506 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0969653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2060  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.2 
 
 		 522 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0934  ABC transporter related  49.3 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0331703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1693  ABC transporter related  48.11 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2166  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  49.6 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1900  ABC transporter related  49.1 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948331  normal  0.18813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1763  ABC transporter related  51.33 
 
 		 504 aa  455  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267477  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2145  ABC transporter related  51.75 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0106398  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0533  ABC transporter, ATP-binding protein  50.84 
 
 		 567 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1418  ABC transporter related  48.21 
 
 		 544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069949  normal  0.112153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5055  ABC transporter related  48.39 
 
 		 521 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3945  hypothetical protein  50.7 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136005  normal  0.317773 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3557  ABC transporter ATPase  49.7 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419368  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3240  ABC transporter related  49.9 
 
 		 507 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0754333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  49.1 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1698  ABC transporter related  48.41 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508023  normal  0.0695334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2017  ABC transporter related  48.61 
 
 		 534 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1120  ABC transporter related  48.91 
 
 		 534 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  45.54 
 
 		 511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  42.31 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 511 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  42.19 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.45 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.45 
 
 		 507 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.93 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.6 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  42.91 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  44.25 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  41.52 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.32 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  43.74 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.95 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40.56 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.44 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  43.13 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  43.85 
 
 		 509 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.12 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  43.54 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  42.08 
 
 		 514 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.88 
 
 		 521 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  43.94 
 
 		 504 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.04 
 
 		 503 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  43.8 
 
 		 503 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  39.11 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.24 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  360  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 510 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 516 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  41.41 
 
 		 525 aa  359  6e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 510 aa  358  9e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  42.94 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>