More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1648 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  58.52 
 
 		 622 aa  727    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 623 aa  1266    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  59.46 
 
 		 626 aa  723    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  51.59 
 
 		 625 aa  599  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  47.57 
 
 		 636 aa  597  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  48.57 
 
 		 631 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 		 631 aa  559  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 		 631 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 631 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 631 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  45.47 
 
 		 631 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  45.47 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  45.47 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  44.99 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 630 aa  534  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 		 627 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  43.1 
 
 		 653 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  42.65 
 
 		 625 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  42.65 
 
 		 625 aa  502  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  43.97 
 
 		 639 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  41.81 
 
 		 629 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  44.01 
 
 		 643 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  42.2 
 
 		 632 aa  485  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 622 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  40.88 
 
 		 630 aa  475  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  41 
 
 		 632 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  42.29 
 
 		 642 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 630 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  40.86 
 
 		 630 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  39.01 
 
 		 642 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  40.41 
 
 		 613 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 		 623 aa  443  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  40.76 
 
 		 631 aa  443  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  38 
 
 		 642 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  39.84 
 
 		 634 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  38 
 
 		 621 aa  435  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  38.1 
 
 		 642 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  39.49 
 
 		 630 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  39 
 
 		 620 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  39.31 
 
 		 641 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  38.09 
 
 		 620 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  37.54 
 
 		 646 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.76 
 
 		 626 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  37.19 
 
 		 640 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 622 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  36.31 
 
 		 641 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  35.84 
 
 		 641 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  38.36 
 
 		 631 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  37.97 
 
 		 633 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  36.43 
 
 		 644 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 		 652 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  36.11 
 
 		 723 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  35.5 
 
 		 633 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 632 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  36.71 
 
 		 636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  36.52 
 
 		 634 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41351  predicted protein  34.47 
 
 		 679 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 		 641 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.04 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  33.17 
 
 		 600 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  33.17 
 
 		 600 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  36.55 
 
 		 631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0540  ABC transporter ATP-binding protein uup  36.24 
 
 		 644 aa  341  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.692263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  34.73 
 
 		 642 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3785  ABC transporter related  35.05 
 
 		 628 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  34.7 
 
 		 663 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 632 aa  336  7.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  35.27 
 
 		 642 aa  336  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  34.86 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3059  ABC transporter related  34.89 
 
 		 628 aa  335  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  33.96 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  34.1 
 
 		 651 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  35.76 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0644  peptidase T (tripeptide aminopeptidase; aminotripeptidase; tripeptidase)  35.68 
 
 		 643 aa  332  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  34.18 
 
 		 626 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1284  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.33 
 
 		 670 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  34.9 
 
 		 620 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2893  ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 		 620 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.669618  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  35.62 
 
 		 634 aa  330  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 559 aa  329  7e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  33.44 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 		 553 aa  327  5e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1794  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 555 aa  327  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  35.11 
 
 		 642 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 555 aa  327  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.01 
 
 		 557 aa  326  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2105  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 555 aa  326  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 		 554 aa  326  9e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.22 
 
 		 556 aa  326  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 		 561 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1013  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 		 555 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 		 642 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  34.74 
 
 		 642 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.01 
 
 		 564 aa  324  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1527  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 		 559 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 559 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>