275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1267 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 276 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  42.38 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  45.65 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  44.24 
 
 		 270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  45.05 
 
 		 274 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.75 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.49 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  43.28 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  49.58 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.17 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  46.47 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  41.01 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  40.98 
 
 		 274 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  43.45 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  43.55 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  41.18 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  42.32 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  40.07 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  39.03 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  46.47 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  42.97 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  38.15 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  43.57 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  39.51 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.33 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.33 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.33 
 
 		 443 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  36.29 
 
 		 449 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.28 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  38.55 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.86 
 
 		 445 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 		 446 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  36.13 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.5 
 
 		 445 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.67 
 
 		 279 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  40.82 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.02 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.49 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  24.39 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.28 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.93 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  29.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  26.95 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  27.63 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  39.51 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.55 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.42 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 		 186 aa  62  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.54 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.54 
 
 		 178 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.06 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.39 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.3 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  42.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.71 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  30.69 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.08 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  37.35 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.55 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  45 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.65 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.79 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  45 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.53 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.77 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.77 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.77 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.89 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.31 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  42.62 
 
 		 135 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.71 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.09 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.07 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.96 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.96 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  31.71 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.74 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.06 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.46 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  31.71 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.19 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  39.13 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  34.78 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.3 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>