More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1093 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  765    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  66.83 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  62.94 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  60.79 
 
 		 420 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  59.7 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  50.85 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  46.88 
 
 		 414 aa  339  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 432 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 416 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 426 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 461 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  32.17 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  43.1 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  31.81 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.98 
 
 		 408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.3 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.3 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.92 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  31.81 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  32.11 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.01 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  32.11 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  32.11 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.01 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.01 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.01 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.01 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.01 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  31.52 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 441 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  28.33 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 456 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 451 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  27 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 440 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 474 aa  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  29.58 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  30.32 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.39 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.43 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.39 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.45 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  31.67 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>