More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0829 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
546 aa  1075    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.25 
 
 
545 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.49 
 
 
568 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.69 
 
 
562 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.06 
 
 
624 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.27 
 
 
552 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.56 
 
 
543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.28 
 
 
543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.28 
 
 
543 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.64 
 
 
571 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.52 
 
 
535 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.29 
 
 
563 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.78 
 
 
716 aa  323  5e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.27 
 
 
708 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.78 
 
 
602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.06 
 
 
557 aa  303  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.3 
 
 
793 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.3 
 
 
1376 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.58 
 
 
598 aa  291  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.76 
 
 
594 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.94 
 
 
590 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.23 
 
 
607 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
630 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
607 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.32 
 
 
646 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.94 
 
 
602 aa  278  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 
611 aa  276  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  44.51 
 
 
611 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.18 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.18 
 
 
608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.51 
 
 
611 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
609 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  44.51 
 
 
609 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
611 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.3 
 
 
590 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
615 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.42 
 
 
588 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 
739 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.47 
 
 
613 aa  273  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.51 
 
 
609 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  44.26 
 
 
615 aa  272  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.52 
 
 
679 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 
615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 
615 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 
615 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 
615 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.71 
 
 
748 aa  269  8e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.53 
 
 
479 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
864 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.92 
 
 
681 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.23 
 
 
601 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.86 
 
 
705 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 
599 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
607 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.45 
 
 
714 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 
599 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.02 
 
 
626 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.28 
 
 
599 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 
603 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.9 
 
 
592 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
607 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
607 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.06 
 
 
615 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
610 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
597 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
607 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 
617 aa  264  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.29 
 
 
607 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.77 
 
 
685 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.21 
 
 
609 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
607 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
610 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.81 
 
 
610 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.13 
 
 
633 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.84 
 
 
503 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 
607 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.72 
 
 
733 aa  264  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.62 
 
 
705 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.74 
 
 
509 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  46.33 
 
 
681 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.19 
 
 
725 aa  263  8.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.33 
 
 
681 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.88 
 
 
608 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.88 
 
 
717 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  33.21 
 
 
637 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 
626 aa  260  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.13 
 
 
637 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 
617 aa  260  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.08 
 
 
731 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.24 
 
 
674 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.26 
 
 
656 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.72 
 
 
724 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
593 aa  259  7e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.43 
 
 
721 aa  259  9e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.81 
 
 
679 aa  259  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  38.81 
 
 
734 aa  259  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>