195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1989 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  67.23 
 
 		 236 aa  306  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.4 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.09 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.35 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.56 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  63.25 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  62.98 
 
 		 231 aa  271  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  66.51 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  65.4 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  65.4 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  65.4 
 
 		 230 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  59.4 
 
 		 241 aa  263  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  65.4 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  60.34 
 
 		 234 aa  262  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  65.88 
 
 		 230 aa  261  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  61.9 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.24 
 
 		 227 aa  254  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.91 
 
 		 230 aa  251  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  60.87 
 
 		 234 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.68 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  58.55 
 
 		 227 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  59.48 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  58.95 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.34 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.5 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  63 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.69 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.51 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  56.96 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  56.77 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  59.15 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  55.16 
 
 		 239 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  48.24 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  49.51 
 
 		 246 aa  188  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.27 
 
 		 224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 236 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  35.68 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.3 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.74 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.87 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.29 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.44 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.17 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.05 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.06 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.6 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  33.18 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.68 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.03 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  38.81 
 
 		 224 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.49 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.98 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  30.54 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  29.18 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.4 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  37.59 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.94 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.15 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 218 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.17 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  39.06 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  32.84 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.07 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.63 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.91 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  33.77 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.99 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.78 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.59 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  27.97 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.83 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  33.83 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.83 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.7 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.84 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.08 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.56 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  38.46 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  32.82 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  32.84 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  27.73 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.69 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  25.22 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.51 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.73 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.27 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  32.56 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  29.92 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>