More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0375 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
380 aa  724    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0480  protein of unknown function DUF214  43.52 
 
 
395 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0816  protein of unknown function DUF214  39.25 
 
 
404 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.89 
 
 
495 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  31.65 
 
 
425 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  32.74 
 
 
655 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  29.56 
 
 
391 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  28.96 
 
 
408 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  31.72 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  25 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  31.03 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  25.13 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 
386 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  27.98 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.36 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  28.62 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.74 
 
 
653 aa  82.8  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  26.78 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  26.05 
 
 
657 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  26.05 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  28.06 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  24.74 
 
 
654 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.19 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  28.39 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.76 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  28.91 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  23.84 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2758  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.49 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.83 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  33.63 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  24.94 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.7 
 
 
403 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.5 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  22.85 
 
 
406 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  27.93 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.06 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30.54 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.07 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  28.76 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  28.76 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.67 
 
 
402 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
383 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  28.76 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.31 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  25.89 
 
 
670 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  27.57 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  22.22 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  25.85 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.9 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  23.51 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.93 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  27.68 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.06 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.87 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  28.73 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.73 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  25.18 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  37.78 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.97 
 
 
656 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  28.73 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  26.3 
 
 
696 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  26.75 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 
443 aa  73.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.27 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.5 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.1 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  23.65 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.02 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.31 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.21 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.43 
 
 
413 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.14 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.91 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  22.91 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  22.3 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>