141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2512 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  49.24 
 
 
201 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  47.47 
 
 
199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
199 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
199 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
199 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  46.73 
 
 
200 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  46.7 
 
 
201 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  44.95 
 
 
199 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  45.69 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  45.92 
 
 
198 aa  171  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
223 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 
200 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 
201 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  44 
 
 
202 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  44 
 
 
202 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  44 
 
 
202 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
200 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
208 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  44.5 
 
 
201 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
200 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
200 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 
207 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
200 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
202 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 
201 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  41.12 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
233 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 
201 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 
197 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 
198 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 
202 aa  115  6e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  32.7 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
237 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
259 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  27.83 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
256 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  29.52 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 
250 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 
252 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
274 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  25.27 
 
 
251 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  30.16 
 
 
237 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
241 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.129059  normal  0.0371904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.59 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.07 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
249 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  28.45 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  29.37 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1800  oxidoreductase  29.37 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.419385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  29.37 
 
 
237 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  29.37 
 
 
237 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.63 
 
 
258 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.32 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  28.45 
 
 
232 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.74 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  23.46 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
249 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  24.14 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10945  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0427  short chain dehydrogenase  29.12 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.7 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.14 
 
 
245 aa  45.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.12 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.74 
 
 
242 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
249 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
259 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
236 aa  44.7  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
247 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  28.67 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  26.12 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>