More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1385 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1385  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692316  normal  0.0515657 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  78.88 
 
 
251 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  78.09 
 
 
251 aa  400  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2763  ABC transporter related  68.13 
 
 
250 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3714  ABC transporter related  66.53 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.473058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3131  ABC transporter related  69.79 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00980337  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1948  ABC transporter related  66.53 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3826  ABC transporter related  67.38 
 
 
250 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  49.79 
 
 
234 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  47.21 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  48.94 
 
 
236 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.07 
 
 
232 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.51 
 
 
236 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  46.84 
 
 
237 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.44 
 
 
232 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  46.84 
 
 
237 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.35 
 
 
233 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  47.41 
 
 
231 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  47.41 
 
 
231 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
231 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  45.06 
 
 
237 aa  207  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  47.03 
 
 
237 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.15 
 
 
235 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
237 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  44.73 
 
 
237 aa  204  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  44.07 
 
 
236 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.26 
 
 
234 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
233 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  44.26 
 
 
249 aa  202  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.96 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  44.96 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5634  ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.07 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0269  ABC transporter related  44.07 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00740442  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  45.49 
 
 
233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.98 
 
 
234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  46.15 
 
 
248 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  44.96 
 
 
237 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
234 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  43.64 
 
 
235 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  46.19 
 
 
234 aa  197  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  47.19 
 
 
231 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  46.19 
 
 
234 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  44.68 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0345  ABC transporter related  45.49 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.636106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  47.01 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  46.98 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  44.58 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.88 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  43.28 
 
 
838 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  43.88 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.68 
 
 
238 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  45.83 
 
 
248 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1162  ABC transporter related  45.61 
 
 
241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.596535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  46.61 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  42.13 
 
 
231 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  43.28 
 
 
238 aa  195  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  43.83 
 
 
238 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  43.7 
 
 
247 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  43.7 
 
 
247 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  43.83 
 
 
236 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  45.76 
 
 
234 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  41.53 
 
 
234 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  50.23 
 
 
246 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.11 
 
 
239 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  43.75 
 
 
238 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
247 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
236 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  43.22 
 
 
259 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  43.28 
 
 
247 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  44.12 
 
 
237 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4335  ABC transporter related  42.8 
 
 
236 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.150909  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  45 
 
 
248 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  44.68 
 
 
235 aa  193  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.8 
 
 
237 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
247 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  44.49 
 
 
236 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  44.17 
 
 
238 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  44.92 
 
 
234 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.55 
 
 
236 aa  192  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.11 
 
 
239 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.28 
 
 
239 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.59 
 
 
235 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  44.49 
 
 
235 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0566  ABC transporter related  43.1 
 
 
241 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.328556  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  46.55 
 
 
251 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
230 aa  191  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  44.86 
 
 
242 aa  191  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  45.76 
 
 
239 aa  191  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  44.54 
 
 
237 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  46.35 
 
 
238 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  43.16 
 
 
234 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  43.22 
 
 
232 aa  190  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 
253 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
234 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>