186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2568 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  815    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  63.36 
 
 
423 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  50.73 
 
 
420 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0290  major facilitator superfamily MFS_1  53.17 
 
 
420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 
440 aa  358  9e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 
428 aa  311  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
423 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3531  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 
399 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  28.47 
 
 
429 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1181  MFS family transporter  25.57 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  25.32 
 
 
393 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  38.26 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1355  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  27.23 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  25.65 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  32.12 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
390 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  30.3 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6420  major facilitator transporter  25.13 
 
 
383 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
396 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  32.56 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  24.87 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  27.65 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  31.34 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  32 
 
 
473 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.94 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.84 
 
 
427 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  27.49 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  25.62 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  24.89 
 
 
453 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  24.89 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  24.89 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  24.89 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.39 
 
 
436 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  24.43 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 
513 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  24.43 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  28.65 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.97 
 
 
500 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
449 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  27.32 
 
 
408 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  24.43 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  27.45 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  32.28 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  26.6 
 
 
525 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  37.5 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  28.88 
 
 
393 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  31.61 
 
 
513 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  30.38 
 
 
523 aa  50.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
434 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
513 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  29.69 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  25.72 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  28.88 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2144  major facilitator transporter  29.86 
 
 
400 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.81 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  28.34 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.06 
 
 
440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.81 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2104  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965781  normal  0.443718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.76 
 
 
493 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.73 
 
 
524 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3199  major facilitator transporter  29.45 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105283  normal  0.0955769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 
520 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  21.9 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  32.23 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  21.87 
 
 
401 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  28.65 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  28.65 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  27.81 
 
 
393 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.45 
 
 
486 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
435 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  27.54 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  28.66 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>