164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4210 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4210  LmbE family protein  100 
 
 		 298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  33.81 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  32.57 
 
 		 274 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  37.43 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1868  LmbE family protein  30.57 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.584409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  33.76 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  34.59 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  30.74 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  45.19 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3179  LmbE family protein  32.7 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0036405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31100  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  32.95 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.714678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  33.57 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0528  LmbE family protein  37.5 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0590  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0604  hypothetical protein  31.41 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.211484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1782  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.612234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  36.99 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0663  LmbE family protein  37.5 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000891678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3467  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0213  hypothetical protein  29.12 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3479  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3268  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000289968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3241  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000243018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3183  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000002506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3524  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1717  LmbE family protein  30.33 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0264749  normal  0.141737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  30.1 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4036  hypothetical protein  26.91 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3496  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.388946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3484  hypothetical protein  31.45 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0766  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  31.58 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1134  LmbE family protein  38.31 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2194  LmbE family protein  30.82 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.646145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  30.42 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0486  hypothetical protein  29.34 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.522878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0402  LmbE family protein  31.65 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  31.65 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  31.67 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  31.91 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3769  hypothetical protein  31.85 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000222568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  27.86 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  28.95 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3908  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidedeacetylase  33.33 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3602  hypothetical protein  31.85 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3888  hypothetical protein  31.85 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.764104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3763  LmbE family protein  28.94 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  34.88 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5063  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  35.42 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4535  LmbE family protein  33.33 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.750354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1124  LmbE family protein  33.73 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.98 
 
 		 484 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  28.8 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3528  LmbE family protein  29.75 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3858  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0881  LmbE family protein  30.41 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.683362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2165  LmbE family protein  34.39 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.083902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0201  LmbE family protein  37.8 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  22.38 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0008  LmbE family protein  28.93 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00173009  normal  0.123538 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0272  LmbE family protein  31.87 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.733991  normal  0.923307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1084  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  30.72 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11830  uncharacterized LmbE-like protein  30.25 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.263602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0988  LmbE family protein  36.71 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  27.07 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0794  LmbE family protein  30.94 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  33.77 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0709  mycothiol conjugate amidase Mca  33.33 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.416669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1146  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  35.06 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0802505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  31.03 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  31.17 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6362  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  34.67 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.797199  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4142  LmbE-like protein  31.03 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4217  LmbE family protein  31.03 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.105692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4373  LmbE family protein  31.03 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11100  mycothiol conjugate amidase mca  30.77 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.24323e-19  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11195  N-acetyl-1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha- D-glucopyranoside deacetylase mshB  35.46 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26080  uncharacterized LmbE-like protein  34.12 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1131  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  28.71 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7629  conserved hypothetical protein LmbE  30.67 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2062  LmbE family protein  38.26 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1235  hypothetical protein  30.86 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000120217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0111  LmbE family protein  27.46 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  36.36 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0651  LmbE family protein  32.28 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5506  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranosidede acetylase  27.23 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3403  LmbE family protein  36.52 
 
 		 245 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31790  mycothiol conjugate amidase Mca  29.93 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  24.6 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8537  conserved hypothetical protein LmbE  30.72 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4034  LmbE-like protein  35.43 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4109  LmbE family protein  35.43 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3098  mycothiol conjugate amidase Mca  30.32 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  0.203495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1157  LmbE family protein  30 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0449  hypothetical protein  30.97 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.869172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3145  mycothiol conjugate amidase Mca  29.8 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  29.41 
 
 		 237 aa  53.1  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0868  LmbE family protein  31.97 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4264  LmbE family protein  34.86 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0925  LmbE family protein  31.97 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0643281  normal  0.488564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0670  mycothiol conjugate amidase Mca  29.49 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>