127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3971 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.37 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.37 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.66 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.63 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.26 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.25 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  29.25 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.04 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.34 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.81 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0247  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 
216 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.590467  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  23.27 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  25.49 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3467  hypothetical protein  28.3 
 
 
213 aa  61.6  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1371  outer membrane protein OmpH, putative  27.54 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000400708  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.35 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  19.57 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.94 
 
 
178 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.41 
 
 
183 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.17 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.94 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.19 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.45 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.11 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.11 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.48 
 
 
175 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3548  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.39 
 
 
221 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000196738  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  28.49 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  26.47 
 
 
177 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  27.21 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.21 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.44 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  27.21 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.03 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  27.81 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.52 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2093  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.52 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000603573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  29.3 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.32 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
171 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  25.69 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.12 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  25.3 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3746  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.81527  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  28.68 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.95 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.74 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.74 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0979  outer membrane protein  26.71 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.74 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.74 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  25.74 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  25.74 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  25.74 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  22.76 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  22.76 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  22.76 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.7 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.49 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1573  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.64 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1110  Outer membrane chaperone Skp  28.32 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.555167  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0572  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.27 
 
 
167 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.67 
 
 
196 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4026  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 
212 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000318638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0861  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.35 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  28 
 
 
196 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  22.42 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  27.59 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  27.59 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.49 
 
 
178 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1447  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.63 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3187  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.65 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.559884  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2998  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.9 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  28.74 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.47 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3044  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.39 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.556672  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  22.35 
 
 
275 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  28.86 
 
 
213 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1600  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.28 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2145  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.06 
 
 
215 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.26588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4177  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.28 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.304502  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0120  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.3 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000286518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  27.53 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2841  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.74 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.61 
 
 
175 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0608  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.29 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.450498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>