111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0459 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0459  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  100 
 
 		 579 aa  1125    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  28.76 
 
 		 522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4293  hypothetical protein  28.49 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.223829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1243  hypothetical protein  31.07 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 523 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  20.29 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5445  methyltransferase small  27.72 
 
 		 552 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1345  N-6 DNA methylase  28.44 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.998293 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.49 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.06 
 
 		 489 aa  92  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1609  hypothetical protein  23.23 
 
 		 521 aa  87.8  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.160321  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13292  DNA methylase  24.74 
 
 		 553 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.909406  normal  0.973481 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.6 
 
 		 694 aa  73.9  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  19.33 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  28.68 
 
 		 573 aa  70.1  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  26.46 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.56 
 
 		 595 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2209  DNA methylase (modification methylase) (methyltransferase)  22.85 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000172069  normal  0.0419277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2534  hypothetical protein  27.78 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1184 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  42.53 
 
 		 298 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.82 
 
 		 287 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  50 
 
 		 286 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2778  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.63238e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1210 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  42.05 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.09 
 
 		 423 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.63 
 
 		 306 aa  51.6  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.85 
 
 		 1956 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.01 
 
 		 389 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  33.33 
 
 		 248 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  43.53 
 
 		 274 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3963  methyltransferase small  34.71 
 
 		 222 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.871033  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  22.44 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.7 
 
 		 296 aa  50.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.78 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  37.36 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03115  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.82 
 
 		 310 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  43.18 
 
 		 291 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  29.47 
 
 		 1701 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.78 
 
 		 1703 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  23.89 
 
 		 950 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2167  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.68 
 
 		 314 aa  47.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 1697 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002862  hypothetical adenine-specific methylase yfcB  31.82 
 
 		 310 aa  47  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0544  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1093 aa  47  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  35.11 
 
 		 680 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  35.44 
 
 		 285 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  34 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1700  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.95 
 
 		 314 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  30.94 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  36.05 
 
 		 245 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  33.72 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  36.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  31.25 
 
 		 289 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  36.25 
 
 		 248 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1405  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.16 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0446695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  36.25 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1435  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.87 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234011  normal  0.0952317 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  31.61 
 
 		 1606 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  28.24 
 
 		 285 aa  46.2  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1391  Methyltransferase type 12  41.1 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.974092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  43.02 
 
 		 325 aa  45.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  45.16 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  34.38 
 
 		 288 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  27.43 
 
 		 1693 aa  45.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.82 
 
 		 293 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.97 
 
 		 317 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  31.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2812  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.58 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.870189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  30.05 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1827  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.16 
 
 		 302 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.92 
 
 		 255 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  45.16 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  29.44 
 
 		 283 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  29.13 
 
 		 280 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  45.16 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3884  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.16 
 
 		 302 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.336989 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  29.71 
 
 		 1702 aa  45.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1231 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18330  putative methylase of HemK family  38 
 
 		 308 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0272783  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  31.58 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  34.13 
 
 		 245 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  46.67 
 
 		 274 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1700  modification methylase NspV  29.89 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  33.9 
 
 		 284 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3930  modification methylase, HemK family  34.18 
 
 		 286 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 1674 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  30.95 
 
 		 288 aa  44.3  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2739  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.23 
 
 		 306 aa  44.3  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  30.59 
 
 		 287 aa  43.9  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  29.14 
 
 		 1417 aa  44.3  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.99 
 
 		 257 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>