194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1800 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1800  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 279 aa  557  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000665627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3580  ApbE family protein, putative  37.32 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3383  ApbE family lipoprotein  37.63 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0906  ApbE family protein, putative  37.06 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00687299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3457  ApbE family protein, putative  37.06 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000973965  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0416  ApbE-like lipoprotein  40 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00253803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0957  ApbE family protein, putative  37.14 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.76647  normal  0.566735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0921  ApbE family protein, putative  37.14 
 
 		 282 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0949043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2657  ApbE family protein, putative  37.87 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00549568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0922  ApbE family protein, putative  36.79 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0767638  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1090  ApbE family protein, putative  36.75 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1846  ApbE family lipoprotein  39.27 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000243371 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5381  ApbE family lipoprotein  39.27 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1180  ApbE-like lipoprotein  37.77 
 
 		 286 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1565  ApbE family lipoprotein  35.85 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0708  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  41.94 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314159  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3433  ApbE family lipoprotein  37.55 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0611  thiamine biosynthesis lipoprotein apbE precursor transmembrane  39.49 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2627  putative thiamine biosynthesis lipoprotein APBE transmembrane  34.53 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0956093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  35.03 
 
 		 350 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  33.52 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 333 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1835  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  33.86 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1886  ApbE family lipoprotein  33.96 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00789462  normal  0.699766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1557  ApbE family lipoprotein  33.09 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.232124 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.29 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.1 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  30.07 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  30.98 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  32.22 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2601  ApbE family lipoprotein  28.01 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  34.39 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.23 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.77 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  30.29 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  37.8 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  31.49 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2058  ApbE family protein  32.22 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.673444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0996  ApbE family protein  32.22 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2113  ApbE family protein  32.22 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.05 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  30.81 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  30.81 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2326  ApbE family protein  31.11 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  30.17 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.6 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  26.25 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  33.54 
 
 		 324 aa  62  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 317 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2411  putative thaimine biosynthesis protein  31.32 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.93 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  25.14 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2906  ApbE family lipoprotein  28.89 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  26.41 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  29.44 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  36.2 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  29.32 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1826  ApbE-like lipoprotein  27.23 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  31.22 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.57 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  28.28 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  28.28 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  25.77 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.81 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1391  ApbE family lipoprotein  28.48 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  28.42 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2154  ApbE family lipoprotein  32.9 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2253  ApbE family protein  32.69 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  25.71 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  31.43 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  29.83 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  28.26 
 
 		 320 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  35.46 
 
 		 386 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.32 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.84 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  30.59 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  32.21 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  29.65 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0575  ApbE family lipoprotein  37.17 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  25.52 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  31.13 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  27.32 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  29.27 
 
 		 374 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 		 341 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  31.82 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.46 
 
 		 337 aa  53.1  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  27.78 
 
 		 344 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>