More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0287 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  100 
 
 
373 aa  736    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  64.6 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  60.21 
 
 
380 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  63.2 
 
 
372 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.09 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  33.75 
 
 
373 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 
404 aa  119  7e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  28.5 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  26.6 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.82 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.18 
 
 
398 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.6 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  32.46 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 
374 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 
384 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.47 
 
 
375 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.77 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.81 
 
 
428 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 
398 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
389 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  32.82 
 
 
397 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  31.76 
 
 
586 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  32.06 
 
 
405 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  30.62 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  32.36 
 
 
411 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 
419 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 
381 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  33.03 
 
 
397 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 
388 aa  107  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  28.38 
 
 
385 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.7 
 
 
392 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  30.84 
 
 
406 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.82 
 
 
400 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
384 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
385 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  29.32 
 
 
380 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  32.16 
 
 
406 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  30.84 
 
 
406 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  30.84 
 
 
406 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.07 
 
 
390 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  31.44 
 
 
404 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  29.23 
 
 
386 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
387 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.01 
 
 
359 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.69 
 
 
400 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  26.88 
 
 
387 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.82 
 
 
400 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2601  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
389 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.08 
 
 
384 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  32.52 
 
 
389 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.55 
 
 
368 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  30.42 
 
 
416 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.57 
 
 
404 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  27.82 
 
 
384 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  28.15 
 
 
386 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
403 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
385 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.6 
 
 
389 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 
413 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  29.07 
 
 
375 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  31.41 
 
 
374 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.43 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.04 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.83 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 
387 aa  95.9  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.19 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.26 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  25.54 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.61 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  27.32 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6551  peptidase M20  25.86 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 
387 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 
391 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  26.14 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3428  peptidase M20  25 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00953913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  28.37 
 
 
392 aa  92.8  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
383 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
383 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  27.54 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.21 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 
398 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>