More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0041 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  100 
 
 
452 aa  893    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  42.99 
 
 
451 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  44.66 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  42.26 
 
 
554 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  42.11 
 
 
451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  38.4 
 
 
455 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  39.02 
 
 
486 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  30.58 
 
 
492 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  30.58 
 
 
492 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  31.52 
 
 
460 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.82 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.03 
 
 
464 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.03 
 
 
464 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.03 
 
 
464 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  35.08 
 
 
461 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.1 
 
 
471 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.11 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.03 
 
 
464 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  30.68 
 
 
473 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.88 
 
 
464 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  30.45 
 
 
498 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  36.69 
 
 
482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.84 
 
 
481 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.31 
 
 
476 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  35.01 
 
 
506 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  30.56 
 
 
471 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  38.18 
 
 
481 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  33.92 
 
 
469 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  31.56 
 
 
464 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  33.18 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.52 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.56 
 
 
495 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.52 
 
 
492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  33.92 
 
 
476 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.29 
 
 
476 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.29 
 
 
476 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.54 
 
 
485 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  36.23 
 
 
484 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  35.83 
 
 
477 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  36.41 
 
 
483 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  33.88 
 
 
415 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  32.12 
 
 
467 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  32.88 
 
 
467 aa  187  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.51 
 
 
440 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  32.77 
 
 
471 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27351  isochorismate synthase  32.81 
 
 
505 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.705522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  31.34 
 
 
466 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30.94 
 
 
453 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30.94 
 
 
453 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  33.68 
 
 
407 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  30.18 
 
 
466 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  32.13 
 
 
456 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  34.16 
 
 
473 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  31.35 
 
 
432 aa  177  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  33.66 
 
 
475 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  32.15 
 
 
452 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  32.15 
 
 
452 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  31.88 
 
 
452 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.88 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.49 
 
 
468 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  32.68 
 
 
412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  34.05 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  32.83 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  33.78 
 
 
460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  29.88 
 
 
477 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.64 
 
 
435 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.31 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  34.13 
 
 
428 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  32.2 
 
 
409 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  33.89 
 
 
435 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  37.59 
 
 
452 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  32.43 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  33.52 
 
 
452 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2047  isochorismate synthase  32.96 
 
 
473 aa  168  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.489046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  37.88 
 
 
452 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  33.13 
 
 
435 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  41.9 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  30.86 
 
 
452 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  35.5 
 
 
386 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  31.31 
 
 
475 aa  166  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.21 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1562  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.65 
 
 
435 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  34.96 
 
 
384 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  32.03 
 
 
414 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  40.42 
 
 
473 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  29.03 
 
 
465 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  29.91 
 
 
465 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  27.9 
 
 
482 aa  160  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  27.62 
 
 
379 aa  160  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  30.36 
 
 
469 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1588  isochorismate synthase  33.23 
 
 
455 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1044  isochorismate synthase  35.8 
 
 
440 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0230464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1786  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.93 
 
 
455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1481  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.74 
 
 
455 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  33.58 
 
 
395 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3284  isochorismate synthase  32.28 
 
 
432 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  34.85 
 
 
452 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>