162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1906 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0389  TonB-dependent receptor  66.28 
 
 
667 aa  861    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1906  TonB-dependent receptor  100 
 
 
693 aa  1379    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1564  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 
654 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.364337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0387  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 
683 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.84983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3532  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.2 
 
 
657 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0796  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 
649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0550386  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1912  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  28.26 
 
 
697 aa  210  8e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0648198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1602  TonB-dependent receptor, plug  30.4 
 
 
652 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1519  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.14 
 
 
677 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3918  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 
681 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000326  enterobactin receptor VctA  25.95 
 
 
668 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000334593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3414  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 
687 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06114  hypothetical protein  31.69 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0996  enterobactin receptor VctA  25.46 
 
 
659 aa  179  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000420276  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0435  heavy metal transport/detoxification protein  25.03 
 
 
668 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1239  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.15 
 
 
646 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1093  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.5 
 
 
654 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1190  TonB dependent receptor domain-containing protein  26.37 
 
 
661 aa  158  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0340628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3030  putaive Fe-regulated protein B precursor  25.26 
 
 
693 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000310305  hitchhiker  0.000241006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2610  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
665 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.846582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 
668 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  26.81 
 
 
676 aa  144  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4401  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
756 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78723  normal  0.0995472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0672  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.68 
 
 
694 aa  138  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41127  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2503  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.1 
 
 
744 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.955771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2622  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 
743 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00560047  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0296  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 
652 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3056  TonB dependent-iron siderophore receptor  28.76 
 
 
644 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4201  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.07 
 
 
686 aa  117  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.325691  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3784  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 
644 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.60396 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4268  GntR domain-containing protein  28.79 
 
 
644 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1054  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.7 
 
 
696 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000147815  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1945  TonB-dependent receptor, plug  36.36 
 
 
300 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583164  normal  0.445387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.1 
 
 
696 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3446  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.48 
 
 
717 aa  111  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494808  decreased coverage  0.00031135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0790  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.57 
 
 
690 aa  110  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000110471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1440  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.83 
 
 
685 aa  110  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0111178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.1 
 
 
696 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2296  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
752 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4591  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.07 
 
 
743 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880102  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1021  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.43 
 
 
696 aa  107  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000037848  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1306  iron-regulated outer membrane protein  22.77 
 
 
692 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000656516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.86 
 
 
681 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1973  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  24.66 
 
 
783 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41369  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0952  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.43 
 
 
696 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000391517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2354  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  25.74 
 
 
778 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548378  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2862  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.78 
 
 
737 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0664764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1580  TonB-dependent heme receptor  23.3 
 
 
737 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1420  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.14 
 
 
739 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330075  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1381  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.14 
 
 
739 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1397  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.14 
 
 
739 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2957  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.14 
 
 
739 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.910627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1308  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  28.06 
 
 
737 aa  98.2  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3235  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.84 
 
 
695 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000386167  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.18 
 
 
661 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3669  heme transport protein  24.67 
 
 
697 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
684 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0162  TonB-dependent iron siderophore receptor  24.7 
 
 
778 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4191  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.97 
 
 
734 aa  91.3  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398881  normal  0.278972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.43 
 
 
688 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1935  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.68 
 
 
722 aa  89.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.51 
 
 
660 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  23.35 
 
 
660 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2132  TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  23.85 
 
 
689 aa  84  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100193  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2415  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.72 
 
 
779 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004277  TonB-dependent heme receptor  24.15 
 
 
730 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1599  TonB-dependent receptor, plug  29.11 
 
 
800 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000304489  unclonable  0.000000404036 
 
 
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26 
 
 
694 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1603  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 
771 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0535477  unclonable  0.000000514373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1017  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.62 
 
 
704 aa  77  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0112436  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  24.95 
 
 
676 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4195  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.46 
 
 
849 aa  75.1  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4089  putative heme utilization protein precursor  23.38 
 
 
851 aa  73.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47380  putative heme utilization protein precursor  23.75 
 
 
851 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0440985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.55 
 
 
676 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.67 
 
 
669 aa  73.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  24.55 
 
 
676 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06116  hypothetical protein  39.29 
 
 
169 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.36 
 
 
764 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  30.29 
 
 
857 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  23.86 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  32.26 
 
 
862 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  20.94 
 
 
698 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  22.94 
 
 
712 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  33.54 
 
 
859 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  22.19 
 
 
728 aa  67.4  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.06 
 
 
862 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.61 
 
 
759 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  31.61 
 
 
862 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.22 
 
 
730 aa  63.9  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  28.74 
 
 
861 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0728  hemin receptor, outer membrane protein  22.37 
 
 
314 aa  63.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.403402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  33.57 
 
 
867 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1858  heme transport protein HugA  21.29 
 
 
683 aa  58.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.76 
 
 
728 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0855  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.87 
 
 
714 aa  57.8  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.842782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0590  hemoglobin and hemoglobin-haptoglobin binding protein B  26.85 
 
 
998 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1943  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
374 aa  57.8  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330013  normal  0.348823 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  20.23 
 
 
731 aa  57.8  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0138  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.1 
 
 
810 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0694219  normal  0.222818 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>