More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0372 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 217 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  39.15 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  40.1 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  39.91 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 		 205 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  39.43 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  40.38 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.91 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  40.28 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  40.85 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  38.97 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  46.29 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  40.37 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  38.22 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  38.55 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  40.58 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  40 
 
 		 187 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.11 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.9 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  31.09 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  30.34 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  31.19 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  34.19 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  30.57 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.71 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.56 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  29 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.92 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  30.39 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.87 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  33.7 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  27.49 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.75 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  33.95 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.17 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.55 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.85 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.85 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.81 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  27.92 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.27 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  27.92 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.47 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  32.88 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.69 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.22 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  27.89 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.98 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  31.65 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.29 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.71 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  35.53 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  35 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  30.34 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00283  neutral amino-acid efflux system  30 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3278  homoserine/threonine efflux pump  30 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3296  homoserine/threonine efflux pump  30 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.46 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0359  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.672304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  28.93 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0352  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2431  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00287  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002089  threonine efflux protein  26.21 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0394  putative homoserine/threonine efflux protein  30 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  31.52 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0399  putative homoserine/threonine efflux protein  29.47 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  33.87 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1343  LysE family translocator protein  40.98 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  29.35 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  29.35 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>