202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2753 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 81 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  45.21 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979703 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2304  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0640  transcriptional regulator, XRE family  32.05 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.33 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1284  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  36.51 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  35.14 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2616  helix-turn-helix domain protein  44.07 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  43.33 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2729  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.909696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3028  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 72 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2937  helix-turn-helix domain-containing protein  37.33 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.84966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1258  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3538  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.902272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0645  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000232876  normal  0.586198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  38.33 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  34.43 
 
 		 107 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  32.79 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0716  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3171  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2082  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  39.34 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2610  putative transcription regulator protein  42.37 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  37.7 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1249  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0411153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1874  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2505  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.400727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0330  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00425  transcriptional regulator, XRE family protein  39.68 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0381282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2655  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>