More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4850 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 255 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 259 aa  288  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 259 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  54.07 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  55.08 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  48.44 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  47.84 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  52.99 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  48.43 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  47.04 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  49.41 
 
 		 253 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  48.22 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  49.8 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  47.04 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  51.17 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  49.42 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  40.62 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.43 
 
 		 260 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.2 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.98 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  35.02 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  37.79 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  36.69 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4915  DeoR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.51 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  30.68 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  34.89 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 252 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.02 
 
 		 269 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  35.91 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  36.44 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.98 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.76 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  39.04 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.8 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.08 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.08 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 248 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.76 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>