250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1865 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  100 
 
 
247 aa  493  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  65.57 
 
 
253 aa  310  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  57.5 
 
 
265 aa  290  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  63.36 
 
 
253 aa  288  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  59.41 
 
 
246 aa  284  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.43 
 
 
272 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  59.92 
 
 
260 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  53.69 
 
 
267 aa  278  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  58.51 
 
 
269 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  58.51 
 
 
269 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  58.51 
 
 
269 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  56.91 
 
 
281 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  59.5 
 
 
270 aa  275  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  59.43 
 
 
254 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  55.83 
 
 
275 aa  269  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  58.26 
 
 
244 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  54.84 
 
 
278 aa  258  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  55.2 
 
 
262 aa  254  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  54.39 
 
 
266 aa  249  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  51.48 
 
 
255 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  52.05 
 
 
248 aa  246  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  52.08 
 
 
282 aa  244  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  51.48 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  56.15 
 
 
270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  51.24 
 
 
252 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  51.08 
 
 
271 aa  239  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  54.31 
 
 
255 aa  238  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  57.14 
 
 
268 aa  237  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  51.9 
 
 
258 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  50.22 
 
 
255 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  47.33 
 
 
247 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  47.22 
 
 
274 aa  225  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  50.66 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  51.09 
 
 
267 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  45.6 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  46.34 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  44.94 
 
 
255 aa  211  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  45.68 
 
 
245 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  36.92 
 
 
239 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  37.85 
 
 
235 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  34.85 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  35.38 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  31.67 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  31.67 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  31.86 
 
 
245 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  30.77 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  29.38 
 
 
254 aa  92  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  31.92 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.19 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  28.68 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  30.15 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.49 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  29.89 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.99 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.21 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  30.14 
 
 
289 aa  72  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.08 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  25.17 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14430  predicted protein  30.33 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0758511  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.39 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.89 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  28.08 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  28.08 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  36.9 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.03 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  27.27 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  34.97 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  27.99 
 
 
302 aa  63.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  26.3 
 
 
317 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.85 
 
 
306 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.1 
 
 
312 aa  62  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1708  fructokinase  26.67 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.485293  normal  0.905174 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.56 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.68 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  32.32 
 
 
314 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  28.57 
 
 
325 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  34.03 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2605  sugar kinase, putative  22.45 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  29.38 
 
 
305 aa  58.9  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  25.41 
 
 
300 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  28.47 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  35.92 
 
 
383 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  33.97 
 
 
399 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  25.5 
 
 
325 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 
293 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
293 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 
293 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  30.41 
 
 
300 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  25 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  25.17 
 
 
299 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.27 
 
 
422 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  27.42 
 
 
302 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  27.97 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  29.15 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.71 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  27.78 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1173  ROK domain-containing protein  34.45 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  33.75 
 
 
398 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>