More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3387 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3387  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 781 aa  1580    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 		 702 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 		 1209 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 		 396 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 351 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  31.07 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 		 1078 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 		 967 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 		 967 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 768 aa  82.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  23.5 
 
 		 1119 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.11 
 
 		 1058 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  34.73 
 
 		 439 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  34.73 
 
 		 439 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 		 439 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 912 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.45 
 
 		 431 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1130 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 1207 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  30.6 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 937 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 935 aa  75.1  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  34.07 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 407 aa  73.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.59 
 
 		 1207 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  25.13 
 
 		 354 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.25 
 
 		 1130 aa  71.6  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  31.85 
 
 		 629 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  30.77 
 
 		 730 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  33.61 
 
 		 695 aa  70.5  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  25.31 
 
 		 1439 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.29 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.7 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  30 
 
 		 708 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 		 705 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  28.98 
 
 		 426 aa  66.6  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  25.25 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  21.81 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.92 
 
 		 628 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  37.21 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  25.25 
 
 		 660 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  25.25 
 
 		 660 aa  64.3  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 674 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  20.78 
 
 		 701 aa  63.9  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.64 
 
 		 613 aa  63.9  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 		 816 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  25.5 
 
 		 660 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  23.01 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  22.09 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  25.5 
 
 		 660 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 654 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.91 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  39.33 
 
 		 660 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 		 658 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  24.38 
 
 		 654 aa  62  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  25.76 
 
 		 660 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.14 
 
 		 650 aa  62  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 		 599 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  25.76 
 
 		 660 aa  62  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 417 aa  62  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.65 
 
 		 599 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.65 
 
 		 599 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 698 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.3 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3248  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 961 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819996  normal  0.0972265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.58 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.77 
 
 		 630 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 875 aa  60.8  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.27 
 
 		 637 aa  60.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  32.2 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.48 
 
 		 658 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.3 
 
 		 630 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0250  putative metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 980 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.270817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  35.63 
 
 		 658 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 630 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.11 
 
 		 695 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.94 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  31.03 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  34.48 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  31.18 
 
 		 652 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  36.47 
 
 		 629 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 		 630 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.04 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>