More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3101 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
369 aa  709    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
904 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 
395 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
373 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  38.31 
 
 
366 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 
390 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  37.95 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
422 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
405 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.1 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
410 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  39.58 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
393 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 
404 aa  86.3  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
427 aa  85.9  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
417 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  35.74 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.68 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.34 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.56 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.56 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.98 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.03 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
416 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.99 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  28.99 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.29 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.24 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.29 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  30.29 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.91 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.88 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
410 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.38 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  36.71 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>