More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2112 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  59.86 
 
 		 292 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  62.15 
 
 		 292 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  63.73 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  61.43 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  61.43 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  61.43 
 
 		 284 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  53.54 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  50.85 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  51.97 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  49.3 
 
 		 348 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  46.89 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 308 aa  201  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  44.17 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  38.13 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  39.5 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  42.12 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  41.18 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 484 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  41.79 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.2 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.49 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  36.39 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  34.08 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  42.12 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  39.27 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  31.67 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.75 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  52.99 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 		 475 aa  105  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.92 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.15 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  35.48 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.73 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  32.26 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 285 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 		 281 aa  95.9  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  43.7 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 		 282 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  34.81 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  43.65 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.56 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.86 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.08 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  37.12 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  34.12 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  31.28 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.65 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.9 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  39.42 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 254 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 		 265 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>