64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0733 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  56.76 
 
 		 117 aa  146  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  42.99 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  42.99 
 
 		 110 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  42.06 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  40.19 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  40.57 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  37.96 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  39.62 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  39.62 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  36.11 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  35.85 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  34.26 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  34.91 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2243  Sterol-binding domain protein  30 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  35.16 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  33.33 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  35.87 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  31.82 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 		 913 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1002  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  34.41 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  34.58 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  35.71 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  35.96 
 
 		 373 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  31.13 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6978  hypothetical protein  30.85 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.664684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  44 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  42.86 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  31.18 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  31.73 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  36.71 
 
 		 375 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  23.36 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4726  Sterol-binding domain protein  42.22 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3788  transcription factor jumonji domain-containing protein  34.09 
 
 		 373 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  30.68 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2819  sterol-binding  43.48 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1843  transcription factor jumonji, jmjC  37.93 
 
 		 376 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.413035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6206  Sterol-binding domain protein  43.48 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.369856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3547  transcription factor jumonji domain-containing protein  29.87 
 
 		 376 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2419  hypothetical protein  39.29 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457886  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  36.23 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1562  sterol-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3107  sterol-binding domain-containing protein  42 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1083  sterol-binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 710 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4957  hypothetical protein  39.22 
 
 		 220 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40664  Oleate-induced peroxisomal protein POX18 (Lipid-transfer protein) (PXP-18)  29.09 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.197968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1315  sterol-binding  31.91 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05484  lipid transfer protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13280)  28.04 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0558  sterol-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 442 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1743  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0765489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>