More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2676 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  554  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.14 
 
 		 282 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.01 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  58.96 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.05 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  47.29 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  43.75 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  44.06 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.59 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  37.29 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  46.48 
 
 		 349 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.16 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  41.43 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  40.79 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  32.45 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  38.61 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  34.8 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  29.11 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.28 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  36.19 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  34.93 
 
 		 330 aa  92.4  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.15 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.03 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  37.82 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  31.14 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  41.48 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  31.18 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.65 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  34.97 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.49 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.36 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  28.3 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.87 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.36 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.83 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.3 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.83 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  30.82 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.83 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.82 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.83 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.15 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.5 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.84 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  28.73 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  27.8 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  32.86 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.75 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.69 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  28.52 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.86 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  30.36 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  30.36 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  27.53 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.8 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  28.12 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  24.82 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.32 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  29.84 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  29.84 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  30.69 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.76 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3175  hypothetical protein  28.79 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>