More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2268 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 765 aa  1523    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  44.67 
 
 		 751 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  75.85 
 
 		 752 aa  1162    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.65 
 
 		 752 aa  843    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  66.4 
 
 		 769 aa  1021    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  64.04 
 
 		 802 aa  962    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  56.98 
 
 		 763 aa  875    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  63.72 
 
 		 808 aa  971    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  41.08 
 
 		 820 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  40.05 
 
 		 806 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.05 
 
 		 793 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.92 
 
 		 793 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  36.98 
 
 		 913 aa  484  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.48 
 
 		 848 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.64 
 
 		 892 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.55 
 
 		 895 aa  465  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  35.11 
 
 		 888 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.6 
 
 		 895 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  33.38 
 
 		 896 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  32.71 
 
 		 893 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.54 
 
 		 767 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.93 
 
 		 770 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.23 
 
 		 920 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  31.5 
 
 		 758 aa  364  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  32.59 
 
 		 760 aa  361  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.65 
 
 		 765 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32.67 
 
 		 784 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.07 
 
 		 769 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  31.52 
 
 		 765 aa  357  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  29.58 
 
 		 785 aa  356  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  31.86 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.98 
 
 		 781 aa  353  8.999999999999999e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.49 
 
 		 750 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  31.72 
 
 		 785 aa  350  8e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.37 
 
 		 769 aa  346  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.75 
 
 		 765 aa  345  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.79 
 
 		 768 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.39 
 
 		 769 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  30.39 
 
 		 768 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.39 
 
 		 769 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.18 
 
 		 768 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.79 
 
 		 769 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.79 
 
 		 768 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.79 
 
 		 768 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.79 
 
 		 768 aa  344  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.93 
 
 		 770 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  30.79 
 
 		 768 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  30.66 
 
 		 769 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  30.66 
 
 		 769 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.66 
 
 		 769 aa  342  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.76 
 
 		 769 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  30.39 
 
 		 769 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  31.29 
 
 		 761 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  30.94 
 
 		 767 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 		 781 aa  335  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  28.68 
 
 		 781 aa  335  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.82 
 
 		 784 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.81 
 
 		 790 aa  333  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.43 
 
 		 770 aa  332  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.4 
 
 		 749 aa  330  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  29.69 
 
 		 763 aa  330  6e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 765 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.55 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  29.72 
 
 		 777 aa  326  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.39 
 
 		 800 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  30.01 
 
 		 778 aa  324  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  29.31 
 
 		 798 aa  324  4e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.57 
 
 		 804 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  29.81 
 
 		 784 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 905 aa  321  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  29.18 
 
 		 845 aa  320  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.76 
 
 		 787 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 		 739 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.52 
 
 		 784 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.27 
 
 		 787 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  29.38 
 
 		 834 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.94 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.37 
 
 		 787 aa  317  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  29.16 
 
 		 786 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.15 
 
 		 787 aa  317  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  28.21 
 
 		 852 aa  316  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.28 
 
 		 799 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  29.38 
 
 		 786 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  29.47 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  30.28 
 
 		 887 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  29.01 
 
 		 834 aa  313  5.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  28.93 
 
 		 841 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 766 aa  313  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  29.69 
 
 		 786 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  29.63 
 
 		 840 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 765 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  27.56 
 
 		 843 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 		 739 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.4 
 
 		 790 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  28.5 
 
 		 796 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.83 
 
 		 758 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  29.41 
 
 		 788 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.62 
 
 		 785 aa  308  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>