283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0931 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  50.51 
 
 		 301 aa  301  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  43.34 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  34.68 
 
 		 202 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  30.96 
 
 		 199 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  31.72 
 
 		 219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  33.33 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  29.48 
 
 		 184 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  34.27 
 
 		 172 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  33.87 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  32.61 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  32.74 
 
 		 188 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  31.15 
 
 		 220 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  34.5 
 
 		 188 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  32.9 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  34.21 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  30.81 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  29.7 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  31.37 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  32.05 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  31.87 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  31.37 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  32.35 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  26.59 
 
 		 190 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  36.54 
 
 		 112 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  29.31 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  27.27 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  35.64 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  37.38 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2817  YceI  28.09 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  35.16 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  29.07 
 
 		 191 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  28.65 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  25.82 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.91 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  28.49 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  28 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  25.14 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  27.91 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 104 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  28 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  28 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  27.37 
 
 		 187 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  35.45 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.15 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  28.65 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  28.48 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 135 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  28.57 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  26.86 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  30.3 
 
 		 201 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  29.52 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.2 
 
 		 147 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  30.3 
 
 		 201 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  35.23 
 
 		 169 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  29.7 
 
 		 192 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  29.55 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3115  YceI family protein  28.81 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0561184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  26.49 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  30.53 
 
 		 201 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 144 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  30.47 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  28.35 
 
 		 189 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  31.68 
 
 		 175 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 135 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  27.88 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  26.17 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0630  YceI family protein  26.86 
 
 		 186 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  24.86 
 
 		 189 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  25.93 
 
 		 144 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1860  YceI family protein  32.22 
 
 		 186 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.7 
 
 		 135 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  30.88 
 
 		 194 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 120 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  30.88 
 
 		 187 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1935  YceI family protein  27.45 
 
 		 191 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  27.22 
 
 		 187 aa  49.3  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  29.08 
 
 		 182 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  26.67 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.79 
 
 		 212 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0606  YceI family protein  26.29 
 
 		 186 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  30.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 		 124 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  29.03 
 
 		 201 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  24.3 
 
 		 144 aa  48.9  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.93 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2381  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  27.22 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  28.4 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  29.92 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  27.22 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  27.22 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  29.92 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>