More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0190 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0190  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 244 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.37345e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0207  pentapeptide repeat protein  86.64 
 
 		 247 aa  293  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000258172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1634  pentapeptide repeat-containing protein  52.94 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  52.33 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  45.54 
 
 		 824 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4550  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  34.85 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.97 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 533 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  41.32 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  44.66 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.73 
 
 		 213 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2153  pentapeptide repeat-containing protein  45.35 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1383  pentapeptide repeat protein  39.09 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.100104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  46.07 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  46.07 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  43 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 		 449 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.82 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  42.71 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1117  pentapeptide repeat protein  48.28 
 
 		 94 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  43.88 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  52.78 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.48 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.6 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.25 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.45 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0183  pentapeptide repeat-containing protein  37.61 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  42.11 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.75 
 
 		 489 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08151  hypothetical protein  37.61 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  44.09 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  44.66 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  47.37 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 		 830 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  42.27 
 
 		 830 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  43.68 
 
 		 483 aa  62  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 877 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 		 1807 aa  62  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  37.5 
 
 		 880 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  48.31 
 
 		 182 aa  62  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  50.62 
 
 		 389 aa  62  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  31.36 
 
 		 949 aa  62  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45.16 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  48 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  42.39 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 880 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  45.05 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  48.31 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  52 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  44.57 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  49.41 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.33 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  41.05 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  45.74 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  44 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  48.31 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  41.05 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  41.05 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.21 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  46.81 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  44.32 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  47.78 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4818  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682722  normal  0.144232 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  44.71 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.6 
 
 		 576 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 446 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  43.18 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  40.78 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3680  pentapeptide repeat protein  45.9 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0611357  normal  0.412611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.6 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  38.2 
 
 		 361 aa  58.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1320  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 		 517 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  50.67 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  50.75 
 
 		 1831 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  40.19 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0857  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  41 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  40.19 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>