More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1079 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1079  aminotransferase class V  100 
 
 		 419 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3650  aminotransferase, class V  74.15 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  68.05 
 
 		 387 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2844  aminotransferase class V  64.6 
 
 		 384 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  64.69 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  62.22 
 
 		 418 aa  462  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  65.19 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  62.56 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  60.15 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  62.86 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  62.94 
 
 		 398 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  62.17 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2457  aminotransferase class V  62.86 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4089  Cysteine desulfurase  62.66 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1443  Cysteine desulfurase  59.59 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.751675  normal  0.957597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  57.95 
 
 		 412 aa  431  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  60.31 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1105  Cysteine desulfurase  62.4 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224155  hitchhiker  0.00251554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10430  cysteine desulfurase family protein  60.05 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2409  aminotransferase class V  61.48 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  60.2 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  60.31 
 
 		 391 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2360  Cysteine desulfurase  57.99 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.66071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1855  aminotransferase, class V  59.34 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712438  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1875  aminotransferase, class V  59.08 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1921  aminotransferase, class V  59.08 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173921  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13041  cysteine desulfurase iscS  58.51 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315275  hitchhiker  0.00290952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1307  aminotransferase class V  63.12 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3255  aminotransferase class V  58.23 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1106  aminotransferase class V  60.41 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1213  aminotransferase, class V  60.15 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.885701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2910  Cysteine desulfurase  57.25 
 
 		 401 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14810  cysteine desulfurase family protein  49.63 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  44.88 
 
 		 400 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  42.26 
 
 		 384 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 399 aa  315  7e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  42.19 
 
 		 384 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  45.31 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 398 aa  305  7e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  44.47 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  42.93 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  45.41 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  40.47 
 
 		 393 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  39.32 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  40.99 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.36 
 
 		 382 aa  298  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.21 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  42.75 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  40.21 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1361  aminotransferase class V  50 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.247137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  44.5 
 
 		 392 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  43.08 
 
 		 402 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  49.13 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.86 
 
 		 393 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  42.56 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  42.01 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2294  aminotransferase class V  46.9 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  41.65 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  43.34 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  46.38 
 
 		 1139 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.16 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  40.62 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  41.47 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  46.76 
 
 		 1143 aa  278  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  41.78 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.73 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2557  aminotransferase, class V  46.49 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.64 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  48.17 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.26 
 
 		 386 aa  272  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.84 
 
 		 402 aa  272  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.26 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2773  aminotransferase class V  47.86 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.89 
 
 		 404 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.7 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  36.68 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  42.08 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.64 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  39.22 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 1135 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  41.3 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  39.01 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  38.54 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  47.14 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  47.15 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.21 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  47.12 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  40 
 
 		 389 aa  263  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.9 
 
 		 384 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  39.53 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  41.15 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>