More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0588 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 671 aa  1359    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  39 
 
 		 679 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.97 
 
 		 732 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 704 aa  256  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  30.03 
 
 		 733 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 		 743 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  29.45 
 
 		 691 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  29.81 
 
 		 715 aa  243  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.78 
 
 		 721 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  30.15 
 
 		 720 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  25 
 
 		 729 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  28.87 
 
 		 739 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25.63 
 
 		 741 aa  230  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  29.63 
 
 		 720 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  26.91 
 
 		 764 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  26.17 
 
 		 717 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.55 
 
 		 738 aa  228  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  30.47 
 
 		 721 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  30.47 
 
 		 721 aa  224  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  30.47 
 
 		 721 aa  224  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  25.52 
 
 		 726 aa  223  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  29.74 
 
 		 687 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  26.68 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  28.9 
 
 		 702 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  28.77 
 
 		 702 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  29 
 
 		 739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  25.66 
 
 		 713 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.26 
 
 		 739 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 		 701 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  27.09 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  26.54 
 
 		 702 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  28.51 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.45 
 
 		 773 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  25.32 
 
 		 702 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.29 
 
 		 733 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  26.35 
 
 		 732 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  25.32 
 
 		 702 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  27.03 
 
 		 727 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  25.75 
 
 		 702 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 		 747 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  25.14 
 
 		 1299 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  27.85 
 
 		 757 aa  191  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 769 aa  190  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  30.08 
 
 		 753 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 		 738 aa  186  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 		 804 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.22 
 
 		 773 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 		 777 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.22 
 
 		 777 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.22 
 
 		 849 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.22 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.22 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 		 726 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 768 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.09 
 
 		 879 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 762 aa  173  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.32 
 
 		 945 aa  168  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.97 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.48 
 
 		 698 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 		 666 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.73 
 
 		 886 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 		 747 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 		 673 aa  161  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 769 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.42 
 
 		 677 aa  158  4e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.26 
 
 		 927 aa  158  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  24.63 
 
 		 835 aa  157  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 		 674 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.2 
 
 		 905 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.66 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.36 
 
 		 674 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.85 
 
 		 676 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.8 
 
 		 893 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.67 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  26.26 
 
 		 746 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  26.33 
 
 		 752 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 700 aa  152  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 		 711 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 676 aa  151  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.33 
 
 		 689 aa  150  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.79 
 
 		 739 aa  150  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.86 
 
 		 979 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  25.62 
 
 		 1135 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 766 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  28.91 
 
 		 909 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.32 
 
 		 915 aa  148  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 692 aa  147  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 		 684 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 688 aa  146  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.63 
 
 		 893 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  25.26 
 
 		 708 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.07 
 
 		 893 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.5 
 
 		 925 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.03 
 
 		 963 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  25.55 
 
 		 669 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.03 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>