More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0308 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  100 
 
 		 709 aa  1384    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  74.33 
 
 		 730 aa  1003    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  44.96 
 
 		 688 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  46.93 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  42.58 
 
 		 901 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  44.96 
 
 		 686 aa  525  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  45.68 
 
 		 686 aa  498  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  40.77 
 
 		 707 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  42.38 
 
 		 662 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  40.86 
 
 		 705 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  40.89 
 
 		 703 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 727 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 710 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  40.62 
 
 		 707 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 725 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  35.03 
 
 		 642 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  40.81 
 
 		 671 aa  334  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  45.92 
 
 		 210 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  44.05 
 
 		 234 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  37.77 
 
 		 207 aa  151  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  40.6 
 
 		 213 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 205 aa  142  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  41.2 
 
 		 281 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  38.34 
 
 		 243 aa  138  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 225 aa  137  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  37.97 
 
 		 222 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  41.03 
 
 		 224 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  35.62 
 
 		 207 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  39.83 
 
 		 202 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  36.25 
 
 		 211 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 215 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  38.26 
 
 		 223 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  36.21 
 
 		 212 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  36.05 
 
 		 213 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  35.56 
 
 		 206 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  40.34 
 
 		 210 aa  126  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  33.19 
 
 		 215 aa  125  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  38.22 
 
 		 222 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  37.07 
 
 		 210 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  32.91 
 
 		 216 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  37.5 
 
 		 214 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  36.05 
 
 		 207 aa  121  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  34.75 
 
 		 225 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  36.64 
 
 		 210 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  39.48 
 
 		 226 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  35.62 
 
 		 217 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  36.68 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  32 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  36.91 
 
 		 206 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  37.99 
 
 		 209 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  32.46 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  37.04 
 
 		 215 aa  118  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  35.5 
 
 		 207 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  32.74 
 
 		 217 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  34.78 
 
 		 205 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  34.41 
 
 		 234 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  37.45 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  46.72 
 
 		 219 aa  116  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  36.21 
 
 		 221 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  38.03 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 203 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  44.65 
 
 		 210 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  37.45 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  37.45 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  37.45 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  37.45 
 
 		 206 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  37.02 
 
 		 206 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  36.25 
 
 		 224 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  35.56 
 
 		 207 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  38.57 
 
 		 226 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  37.67 
 
 		 210 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  36.75 
 
 		 219 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  37.33 
 
 		 211 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  35.19 
 
 		 206 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 206 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  36.86 
 
 		 225 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  37.12 
 
 		 213 aa  114  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  36.62 
 
 		 213 aa  114  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  34.91 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  35.62 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  37.12 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  37.33 
 
 		 232 aa  113  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  34.93 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  34.82 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1407  thymidylate kinase  34.23 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 206 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  33.2 
 
 		 219 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  34.22 
 
 		 208 aa  112  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  36.6 
 
 		 206 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  34.45 
 
 		 215 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.31 
 
 		 210 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  36.17 
 
 		 206 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  36.17 
 
 		 206 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  44.14 
 
 		 204 aa  111  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  36.17 
 
 		 206 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  36.17 
 
 		 206 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  36.17 
 
 		 206 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  35.35 
 
 		 213 aa  111  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  32.34 
 
 		 219 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>