More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3788 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  75.13 
 
 		 543 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1110    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  65.6 
 
 		 445 aa  578  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  64.22 
 
 		 437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  65.22 
 
 		 448 aa  570  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  65.68 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  64.49 
 
 		 448 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  62.92 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  63.11 
 
 		 440 aa  528  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  60.46 
 
 		 455 aa  525  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  59.4 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  55.58 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  55.63 
 
 		 448 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  56.53 
 
 		 445 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  51.85 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  51.61 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  49.2 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  47.37 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  49.2 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  49.2 
 
 		 445 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  47.62 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  47.61 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  46.68 
 
 		 445 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  35.45 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  34.66 
 
 		 476 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  32.64 
 
 		 473 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 		 477 aa  191  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  29.4 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  32.55 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  32.25 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  35.58 
 
 		 470 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.16 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  34.13 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  34.83 
 
 		 432 aa  169  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  31.94 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  33.82 
 
 		 452 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  32.24 
 
 		 564 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  36.05 
 
 		 454 aa  163  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  34.1 
 
 		 481 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  31.5 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  32.64 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  30.37 
 
 		 434 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07540  hypothetical protein  28.64 
 
 		 440 aa  158  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  30.32 
 
 		 455 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  36.81 
 
 		 557 aa  156  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  31.43 
 
 		 469 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  37.1 
 
 		 470 aa  156  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  29.1 
 
 		 440 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  33.14 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  34.92 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  34.28 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3311  ABC-1 domain protein  28.54 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2353  ABC-1 domain protein  34.3 
 
 		 578 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1170  hypothetical protein  33.57 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.9 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  35.92 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49684  predicted protein  32.54 
 
 		 788 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32 
 
 		 451 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  29.72 
 
 		 440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  33.6 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  32.06 
 
 		 453 aa  147  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3267  ABC-1 domain protein  31.56 
 
 		 567 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  33.07 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  30.34 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  35.07 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  35.34 
 
 		 453 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00990  ubiquinone biosynthesis-related protein, putative  31.43 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0509253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  39.54 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06572  molecular chaperone (ABC1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04380)  36.43 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.103291  normal  0.0776112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04036  ABC-1 protein  30.57 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0062  hypothetical protein  27.08 
 
 		 434 aa  140  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  34.95 
 
 		 456 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  34.95 
 
 		 456 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  31.35 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3005  ABC-1 domain protein  32.15 
 
 		 572 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  34.77 
 
 		 473 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.04 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  32.36 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3115  ABC-1 domain protein  32.15 
 
 		 572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  38.81 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  38.81 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  35.71 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  31.55 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  32.58 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.66 
 
 		 559 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1778  hypothetical protein  37.24 
 
 		 619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  37.65 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2782  ABC-1 domain protein  39.92 
 
 		 613 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95149  normal  0.892849 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  33.87 
 
 		 640 aa  134  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  27.5 
 
 		 480 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  33.69 
 
 		 475 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.34 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.94 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  24.59 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  37.21 
 
 		 563 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  32.75 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.78 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>