More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3201 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3201  response regulator receiver protein  100 
 
 		 150 aa  307  4e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2082  two-component response regulator, cheY-like  44.44 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.988257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3183  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1791  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2652  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 242 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0337  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081011  hitchhiker  0.000378914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 292 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1220  CheY-like response regulator  44.96 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0243191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3740  response regulator receiver protein  41.44 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1899  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.727216  normal  0.206125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 148 aa  83.6  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  39.55 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1160 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  36.89 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0148  response regulator, CheY-like  35.94 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  40.16 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  33.87 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  36.64 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0314  histidine kinase  38.13 
 
 		 531 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 		 531 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  35.04 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  42.35 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3744  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.139387  hitchhiker  0.00363561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4337  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  hitchhiker  0.000570677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5055  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000148317  normal  0.0527856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2312  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3763  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113093  normal  0.0284745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1356 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  35.4 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2083  hypothetical protein  37.72 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2589  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0322399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1158 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1464  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000820366  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1134  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461969  hitchhiker  0.00297359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  34.68 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1155  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1095  response regulator receiver domain-containing protein  34.96 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  30.23 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1223  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  40 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  41.67 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0912  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.616011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 359 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 920 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 1161 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  32 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0754  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1201 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0739  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  32.52 
 
 		 1200 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1850  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.549411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  34.81 
 
 		 229 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  34.81 
 
 		 229 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  33.05 
 
 		 1170 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  33.05 
 
 		 1172 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1834  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00302805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1149 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>