60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2566 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 368 aa  753    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  63.17 
 
 		 991 aa  411  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.49 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  36.51 
 
 		 554 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  35.81 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  35.16 
 
 		 482 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  33.56 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  29.05 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  31.45 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.91 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  32.06 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  30.88 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  30.72 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  32.26 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  29.24 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  29.72 
 
 		 346 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  31.43 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  29.41 
 
 		 922 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  28.7 
 
 		 527 aa  92.8  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  25.43 
 
 		 449 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 522 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  29.7 
 
 		 462 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  28.32 
 
 		 594 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  30.71 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  26.15 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  29.69 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  27.44 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  25.7 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  29.81 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  25.7 
 
 		 435 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  23.53 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.36 
 
 		 730 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  24.23 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.37 
 
 		 1316 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  29.1 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  25.88 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  29.84 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.08 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  27.71 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  29.05 
 
 		 919 aa  63.2  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  27.8 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  24.26 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  23.9 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  26.77 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  25.56 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  27.18 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  27.67 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  27.78 
 
 		 1409 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  24.37 
 
 		 543 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  23.79 
 
 		 555 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  25.12 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.41 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  25.89 
 
 		 374 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  37.1 
 
 		 272 aa  46.6  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  25.56 
 
 		 794 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  27.75 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  22.07 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  27.27 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  29.29 
 
 		 143 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  25.64 
 
 		 747 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>