246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2202 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2202  transcription termination factor-like protein  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12923  putative N utilization substance protein  50.83 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1966  N utilization substance protein B  45.87 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1401  NusB/RsmB/TIM44  36.51 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6330  NusB antitermination factor  40.93 
 
 		 378 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6247  NusB antitermination factor  32.14 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0807  NusB family protein  28.91 
 
 		 364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2447  antitermination factor  30.39 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351781  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4924  NusB antitermination factor  32.73 
 
 		 388 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  46.49 
 
 		 165 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  45.69 
 
 		 168 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0496  NusB antitermination factor  55.56 
 
 		 168 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1215  NusB antitermination factor  40.78 
 
 		 146 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  55.56 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0422  hypothetical protein  31.74 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1988  NusB antitermination factor  54.32 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1679  NusB antitermination factor  54.32 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0417  NusB antitermination factor  51.22 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0505  NusB antitermination factor  51.85 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1043  NusB antitermination factor  47.22 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  39.33 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  43.42 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  38.2 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  34.4 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  32.46 
 
 		 151 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  33.96 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  38.46 
 
 		 138 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.96 
 
 		 145 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  36.54 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  34.94 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 154 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  35.21 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  36.63 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  39.73 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  35.06 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  46.67 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4342  transcription antitermination protein NusB  31.25 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1860  NusB antitermination factor  29.75 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  34.44 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1002  NusB antitermination factor  32.61 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  43.55 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  36.84 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  38.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  35.29 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0301  transcription antitermination factor NusB  31.4 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  42.25 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0477  NusB antitermination factor  31.4 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.144816  hitchhiker  0.000124521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4034  transcription antitermination protein NusB  45.76 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1589  NusB antitermination factor  32.63 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  30.77 
 
 		 150 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  39.68 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  35.79 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  41.94 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  42.37 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  40.32 
 
 		 141 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  29 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  30.53 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3255  NusB antitermination factor  30.36 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.489842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  40.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  35.96 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  30.56 
 
 		 167 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  30.59 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  39.68 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  44.07 
 
 		 130 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  34.09 
 
 		 154 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  36.07 
 
 		 166 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  39.68 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  36.76 
 
 		 143 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5041  transcription antitermination protein NusB  28.85 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.264759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  44.07 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  31.73 
 
 		 139 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  44.07 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0751  NusB antitermination factor  30.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000652564  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1714  NusB antitermination factor  39.34 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  34.44 
 
 		 132 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 130 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  31.11 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  31.4 
 
 		 163 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  31.17 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1654  N utilization substance protein B  35.82 
 
 		 198 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00612472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0276  transcription antitermination protein NusB  42.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  32.69 
 
 		 139 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  39.06 
 
 		 135 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1444  NusB antitermination factor  35.62 
 
 		 145 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  29.35 
 
 		 155 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0985  NusB antitermination factor  32.89 
 
 		 142 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 211 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1038  NusB antitermination factor  29.7 
 
 		 148 aa  52.4  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000780031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1478  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 235 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.705133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>