More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0825 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0825  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
292 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01430  pantoate--beta-alanine ligase  54.61 
 
 
283 aa  319  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1507  pantoate/beta-alanine ligase  54.68 
 
 
280 aa  299  4e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.12 
 
 
280 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0477  pantoate--beta-alanine ligase  41.94 
 
 
281 aa  226  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4557  pantoate/beta-alanine ligase  44.96 
 
 
280 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  45.35 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.58 
 
 
526 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3835  pantothenate synthetase  41.7 
 
 
283 aa  211  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  42.34 
 
 
279 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  51.46 
 
 
289 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.59 
 
 
279 aa  206  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.7 
 
 
280 aa  206  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.87 
 
 
280 aa  205  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  42.54 
 
 
283 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.32 
 
 
511 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2251  pantoate--beta-alanine ligase  38.16 
 
 
307 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.32 
 
 
511 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  45.21 
 
 
280 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.89 
 
 
529 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.61 
 
 
528 aa  202  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.64 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.64 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  42.31 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  41.44 
 
 
539 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  40.99 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  38.97 
 
 
527 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  42.59 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2315  pantoate--beta-alanine ligase  39.5 
 
 
286 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  40.62 
 
 
293 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  39.36 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2846  pantoate--beta-alanine ligase  47.22 
 
 
289 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  41.11 
 
 
289 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  40.6 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  40.23 
 
 
283 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03551  pantothenate synthetase  41.35 
 
 
282 aa  195  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2560  pantoate--beta-alanine ligase  39 
 
 
284 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  45.34 
 
 
291 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  38.85 
 
 
278 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0403  pantoate--beta-alanine ligase  38.1 
 
 
279 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 
286 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  39.01 
 
 
282 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  39.58 
 
 
309 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2314  pantoate/beta-alanine ligase  40.75 
 
 
284 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000496833  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  39.55 
 
 
282 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.26 
 
 
534 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  38.04 
 
 
276 aa  191  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1658  pantoate--beta-alanine ligase  38.32 
 
 
282 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.752293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  39.19 
 
 
282 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1757  pantoate--beta-alanine ligase  38.1 
 
 
279 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  36.75 
 
 
283 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  40.65 
 
 
284 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2495  pantoate--beta-alanine ligase  38.99 
 
 
280 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0404  pantoate/beta-alanine ligase  38.54 
 
 
281 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302391  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0579  pantoate--beta-alanine ligase  39.33 
 
 
289 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  40.74 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  41.8 
 
 
288 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3439  pantoate--beta-alanine ligase  39.62 
 
 
280 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  40.77 
 
 
277 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
284 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  40.36 
 
 
300 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  39.93 
 
 
284 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  36.03 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2042  pantoate/beta-alanine ligase  37.15 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  38.32 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  38.65 
 
 
282 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22955  predicted protein  38.54 
 
 
311 aa  188  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.271201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3689  pantoate/beta-alanine ligase  38.49 
 
 
285 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  37.91 
 
 
291 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  38.54 
 
 
290 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  36.23 
 
 
291 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0201  pantoate--beta-alanine ligase  40.29 
 
 
284 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.17692  normal  0.688359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  39.71 
 
 
284 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  39.85 
 
 
277 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  38.55 
 
 
287 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  39.08 
 
 
286 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3320  pantothenate synthetase  37.73 
 
 
290 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 
283 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  40.15 
 
 
281 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  46.34 
 
 
283 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  40.62 
 
 
279 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  44.55 
 
 
281 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  38.01 
 
 
284 aa  186  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  40.57 
 
 
301 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  36.33 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  43.63 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  39.42 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  38.79 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  37.82 
 
 
287 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3134  pantoate--beta-alanine ligase  39.78 
 
 
282 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.398811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  41.09 
 
 
279 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>