62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0804 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  100 
 
 
1280 aa  2551    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  44.63 
 
 
1114 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  44.55 
 
 
1021 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  45.14 
 
 
1351 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  43.06 
 
 
1436 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.15 
 
 
3563 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.35 
 
 
1991 aa  261  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  29.26 
 
 
1027 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.48 
 
 
1183 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  30.29 
 
 
857 aa  217  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2703  hypothetical protein  44.89 
 
 
277 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0106658  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3108  hypothetical protein  44.44 
 
 
278 aa  203  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3818  hypothetical protein  44.64 
 
 
276 aa  202  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.23 
 
 
1588 aa  135  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.82 
 
 
1176 aa  129  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  24.66 
 
 
1585 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  35.05 
 
 
901 aa  116  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  23.54 
 
 
1176 aa  115  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  30.03 
 
 
889 aa  109  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  26.84 
 
 
1100 aa  108  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  31.18 
 
 
858 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  28.83 
 
 
864 aa  100  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  31.65 
 
 
665 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  27.13 
 
 
523 aa  99.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3296  hypothetical protein  28.43 
 
 
599 aa  99  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649098  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.82 
 
 
2807 aa  96.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  30.57 
 
 
1933 aa  95.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.75 
 
 
2198 aa  91.7  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.19 
 
 
8871 aa  87.4  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.24 
 
 
1523 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  32.2 
 
 
2467 aa  82  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  25.34 
 
 
1140 aa  81.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  26 
 
 
740 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.58 
 
 
429 aa  67.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.81 
 
 
1454 aa  66.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  23.25 
 
 
1134 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  26.04 
 
 
841 aa  63.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.24 
 
 
1068 aa  62.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  25.52 
 
 
429 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  23.68 
 
 
1051 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  23.68 
 
 
1053 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  28.96 
 
 
943 aa  56.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  22.94 
 
 
1084 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 
696 aa  54.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  21.5 
 
 
734 aa  52.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  22.2 
 
 
2416 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  34.68 
 
 
425 aa  51.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08596  hypothetical protein  22.3 
 
 
659 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.53584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  28.51 
 
 
440 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  29.28 
 
 
661 aa  50.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  23.63 
 
 
2650 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  31.58 
 
 
646 aa  49.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  20.87 
 
 
888 aa  48.9  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  25.52 
 
 
400 aa  48.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  24.07 
 
 
569 aa  48.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  25.7 
 
 
726 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  22.61 
 
 
1331 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  33.59 
 
 
1916 aa  47  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.77 
 
 
2122 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.06 
 
 
1656 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  27.63 
 
 
322 aa  45.4  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.3 
 
 
1163 aa  45.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>