More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3018 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  66.94 
 
 		 262 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4108  transcriptional regulator, RpiR family  28.14 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  28.26 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1200  transcriptional regulator, RpiR family  26.44 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  28.11 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  25.76 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0464  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.142049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2006  RpiR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3311  transcriptional regulator, RpiR family  29.38 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1541  transcriptional regulator  22.61 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2814  transcriptional regulator, RpiR family  31.39 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  28.44 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  26 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2247  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  23.61 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0672  transcriptional regulator, RpiR family  24.9 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.654483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  26 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0694  RpiR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1678  transcriptional regulator  22.89 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00566045  normal  0.0111544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  27.4 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1477  RpiR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.26952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2807  RpiR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2433  transcriptional regulator, RpiR family  23.77 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000784459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  23.18 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2730  RpiR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  26.98 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.83 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.42 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  28 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0750  RpiR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  26.43 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5676  RpiR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  26.89 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  25.22 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  27.75 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0225  transcriptional regulator  21.54 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  27.95 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  26.42 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3841  transcriptional regulator, RpiR family  23.64 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0070  RpiR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  26.02 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  28.81 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.99 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  24.55 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  27.05 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  27 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1910  phosphosugar-binding transcriptional regulator  24.15 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0941  RpiR family transcriptional regulator  26 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0472093  normal  0.387072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1962  transcriptional regulator, RpiR family  23.44 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1355  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.906845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2059  RpiR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  25.84 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0365  RpiR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2724  RpiR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2499  RpiR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0147  transcriptional regulator  22.81 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.94 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  23.94 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>